莖基腐病是百香果的主要病害之一，由於發病部位偏下，初期不易察覺，當地上部分表現出枯葉縮果時，病斑已是環繞莖幹，神仙難救，常給果農帶來重大損失，是一種毀滅性病害。
田間症狀
在發病初期，病部首先會產生顏色上的變化，一般是深褐色的。
隨著病情加重，病部皮層會產生裂痕、變軟、腐爛，易與木質部脫離。
當溼度比較大時，病部表面會產生粉白色的病原物；高溫多雨季節，病斑擴展迅速，可向下蔓延至根群。
感病樹地上部分常表現為枝蔓和葉片黃化、凋萎，果實皺縮失水，然後整株植株枯萎死亡。
發生規律
病原菌： 一般是由多種病原菌聯合或單獨侵染所致，其中以鐮刀菌、腐黴菌等為主。
發病規律：病菌以菌絲體在田間植株、病殘物或土壤中存活和越冬，藉助風雨和灌溉水傳播，通過農事活動、蟲害、風害造成的傷口侵入植株，5~8月為發病高峰期。
流行因素：①連作年限越長，土壤中積累病菌越多，發病越重；②土壤粘重、通風透光差、長期積水的果園易發病；③土壤酸化、菌群失調的果園發病重；④夏季強降雨後果園常時間積水，易造成此病的爆發；⑤因施肥、除草不當或白蟻、蠐螬等地下害蟲多而造成根系、莖基部傷口多，易受侵染。
預防及補救
選用抗病砧木：不少果農存在一個誤區，認為所有嫁接苗都是抗病的，實際上抗不抗病主要看砧木的抗病性，固建議選用抗病強的黃色種作砧木的嫁接苗。
注重土壤管理：莖基腐病屬於典型的土傳病害，所以對於土壤的養護及管理，是減少田間發病的重要環節。主要包括連作地塊種前整地、曬地，降低病原基數；地勢低、排水差的地塊起壟栽培；增施有機肥、菌肥，配合淋施海精靈生物刺激劑根施型，以改良土壤環境，壯大有益菌群，起到以菌治菌的作用。
加強栽培管理：及時修剪，保持果園通風透光，減少果園陰蔽程度；大雨過後，要及時排除積水，防止果園積水；加固棚架，減少因風害引起的莖部損傷，並注意地下害蟲、線蟲等防治工作。
積極預防補救：高溫多雨期，每隔20天用灌一次敵克松/咯菌腈+高錳酸鉀預防，巡園時發現葉片發黃或出現凋萎現象，要及時檢查莖部和根部。發病初期扒開莖基部土壤，刮除病部，用甲霜噁黴靈、絡氨銅、氯溴異氰尿酸、噁黴靈·福美雙等灌根及塗抹病部。
及時處理死株：對於發病嚴重救治無望的，及時連根挖出，帶出園外銷燬，並在病穴施撒石灰進行土壤消毒。
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