豆苗爸
《拳皇》99开始，故事背景就正式进入音巢篇。虽然草薙京和八神仍然是主角，但是第一主角却变成了改造人K'。
因此所有的故事背景几乎都是围绕K'的主线完成的，而八神和草薙京却成为隐藏人物，在选人界面不适用秘籍还不能使用。
本作的最终BOSS古利查力度，实际上的战斗力是低于K'的，但是为了打造出BOSS气场，在游戏中设定是非常强悍的人物。他的很多招式都是无责任的，“红美玲”曾经是多少玩家的阴影。
但是很多玩家不知道的是，拳皇99还有隐藏BOSS，那就是被困音巢内部的草薙京和寻找草薙京的八神庵，满足一定条件就可以遇到他们并交战。
“拳皇”从《拳皇95》至今，历代游戏作品从来都不会缺少隐藏要素的设计，隐藏角色的秘籍指令、隐藏剧情的触发条件在广大玩家之间广为流传。
《拳皇99》作为“音巢篇”剧情的第一部作品，隐藏要素自然没少，最被玩家熟知的应该就是在选人界面的问号处按住“开始”键后摇出指令“左右上左下右，右左上右下左”，分别可以选出“真草薙京”与“八神庵”
另外，对于打败最终boss古利查力度之后，玩家可以挑战乱入的“真草薙京”或“八神庵”这个隐藏要素，可能有很多人都不知道。
下面来说下挑战乱入的“真草薙京”与“八神庵”的触发条件：
八神庵乱入：选择完整的一组角色成功打败“古利查力度”通关之后，游戏得分在200分与280分之间，玩家即可对战乱入的八神庵。
真草薙京乱入：选择完整的一组角色成功打败“古利查力度”通关之后，游戏得分在280分上，玩家即可对战乱入的真草薙京。
对于很多玩家来说打出真草薙京倒是很容易，但八神庵却不容易打出，因为游戏得分稍微打一打就能轻松超过280分，所以将游戏得分控制在280分以内还是很不容易的。
另外还有些隐藏剧情需要特定队伍才能打出：
选主角队（或称“K”队，音巢篇主角“K”），通关之后出现的真草薙京剧情会与其他队有所不同。
选饿狼队，用不知火舞打败“古利查力度”，会出现饿狼队的第二种结局动画。
选超能力队，用椎拳崇打败“古利查力度”，也会出现稍有不同的结局动画。
街机时代
哇，这是个什么游戏？听起来好酷哦。。
巴神是什么东西？？看好厉害的样子。。
古力查力度四个毛？听起来好。。。胡诌八扯这样子………
朋友，你要知道有时候ag拉不是万能的………
这种杂游戏我可是不玩喽………
