厄魯特蒙古中最強大的是準噶爾部，與和碩特部，其中和碩特部首領是成吉思汗的弟弟合撒兒的子孫。準噶爾部噶爾丹稱汗之後，和碩特部受到威脅，和碩特首領鄂齊爾圖汗的叔叔固始汗決定轉移牧地。
明末清初，固始汗借西藏內亂之機，率領和碩特部進據青海。擊敗喀爾喀卻圖汗，成為青藏高原的新霸主。後來青海和碩特蒙古諸部是固始汗的子孫，康熙末年諸部中最強大的是固始汗長子達什巴圖爾的兒子羅卜藏丹津。
固始汗
準噶爾侵藏過程中，西藏的拉藏汗被殺，羅卜藏丹津妄圖繼承西藏王汗位。於是向清軍統帥大將軍王胤禵請求入藏稱汗，遭到清廷拒絕；他又想成為青海和碩特蒙古各部的大汗，清廷為防止蒙古各部聯合起來有離心傾向，於是晉封青海和碩特蒙古郡王察罕丹津為親王、加封貝子額爾德尼為郡王，另其二人共領青海和碩特蒙古右翼。
清廷的這些做法使羅卜藏丹津做西藏之王、一統和碩特蒙古部的美夢成為泡影，失望之極的羅卜藏丹津開始密謀叛亂。
康熙六十一年（1722年），清聖祖康熙去世，撫遠大將軍胤禵被解除兵權，回京奔喪。羅卜藏丹津於雍正元年（1723）年在察罕託羅海舉兵叛清，羅卜藏丹津脅迫青海蒙古諸部隨其共同舉兵，但是察罕丹津親王、額爾德尼郡王等人拒絕參加，並率部投向清朝。
雍正皇帝
羅卜藏丹津囚禁清朝使臣，煽動青海格魯派寺廟參與叛亂，一時間在青海遊牧的蒙古各部、喇嘛、數十萬人風起雲湧、騷動不安。
雍正皇帝剛剛繼位，繼續安定的外部環境來鞏固統治，決定堅決鎮壓羅卜藏丹津之亂。川陝總督年羹堯被任命為新任撫遠大將軍，四川提督嶽鍾琪參贊西北軍務，同時發佈上諭令西北平逆將軍延信、四川、陝西、雲南三省聽從年羹堯調遣。
年羹堯率軍擊敗羅卜藏丹津，並剿滅被煽動的青海各寺喇嘛，羅卜藏丹津逃往柴達木地區，西寧一帶被清軍收復，十餘萬和碩特蒙古歸順清朝。
年羹堯
雍正皇帝緊接著命嶽鍾琪率軍直搗柴達木，清軍在烏蘭和爾擒獲大批叛軍，抓獲羅卜藏丹津之母與胞妹。羅卜藏丹津本人逃往準噶爾部，為其首領策妄阿拉布坦收留。
清朝平定羅卜藏丹津之亂後，批准了年羹堯提出的《青海善後事宜十三條》以及《禁約青海十二事》，在青海建立穩固的統治。
羅卜藏丹津之亂
青海蒙古各部被重新編組劃分，各部首領按照表現進行賞罰。其中和碩特部21旗、綽羅斯2旗、土爾扈特4旗、輝特1旗、喀爾喀1旗，設置札薩克來管理各旗，將諸蒙古分而治之。青海的遊牧藏民也被編為民戶，直接受清朝官員的管理；青海各喇嘛寺廟因協助叛亂，被嚴格限制規模。
雍正三年，雍正皇帝決定將青海內屬，在西寧設置西寧府。任命“辦理青海蒙古番子事務大臣”，總理青海一切事物，從此青海直接隸屬於中央政府管轄之下，成為中國堅實而不可分割的一部分。
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