我们都爱想念熊
质能方程我们都知道E=mc^2，这个方程有说“在化学反应中不成立”吗？
并没有！这说明质能方程同样适用于化学反应。事实上，我们通常所说的“化学反应并没有损失质量”只是“没有必要考虑损失的质量”，因为太微小太微小了，电磁力相对于原子内部的强核力来讲太微弱了，完全可以忽略不计！
质能方程是需要考虑相对论效应的，在这种效应下，物体质量也分为静止质量和运动质量两部分组成，我们所说的化学反应质量并没有变化，指的是静止质量没有变化。但运动质量是有变化的，因为粒子在不同运动状态下的质量（运动质量）是不完全相同的。
氧气和氢气燃烧之后虽然原子并没有什么变化，用化学公式来看也的确如此：2H2+O2=2H2O，看起来一切都没有变化！但实际上是有某种变化的。在燃烧过程中，电子的轨道半径已经发生了改变，电子会跃迁到靠近原子核的轨道，同时释放出能量，这个过程中确实损失了非常少的一丢丢质量，可以根据相对论效应计算出来。
能量即质量，质量也是能量，两者就像一个东西的两面性，是完全等价的。
可以用E=mc^2计算一下，氢气和氧气燃烧释放的能量换算成质量实在少得可怜，这种能量与原子核内部的强核力比较完全可以忽略不计。所以通常情况下，我们会认为E=mc^2只适用于核反应，实际上E=mc^2适用于一切能量和质量转换的反应！
不然的话，E=mc^2这个公式就会加上一个前提：不适用于化学反应！
宇宙探索
质能方程是物理过程。氢气和氧气反应生成水是化学反应过程，这个过程和e=mc^2没有关系。楼主应该是想问过程中产生了光和热是质量损失转化而来的吗？这些热和光是由于电子能级跃迁产生的。氧气是两个氧原子共享两个电子形成的稳定结构，氢气是两个氢原子共享一个电子形成的稳定结构。燃烧变成水后，以前的两个氢原子离婚，以前的两个氧原子也离婚，然后这两个离婚后的氢原子都嫁给了氧原子。他们三个一共共享了两个电子。这个过程电子的能级从高能级跃迁到了低能级，产生了光和热。但是原子的个数和类型都没有发生变化，质量守恒。
再补充一下，有些观点认为这个过程产生的能量变化应该符合质能方程，引起了了质量的变化，只是变化量特别小而已。我认为这种观点不对。质能方程是衡量质量和能量之间转化时的量级关系，但是不意味着所有热能都是通过质量转化而来的。在题主的例子里，这些热能是电子的能级跃迁产生的，本质是电子的动能加上电子和原子核之间的势能变化产生的。这个过程每个电子和原子核的质量都没有发生改变，数量也没有改变。因此理论上质量应该是不变的。
再补充一下，谈到质量有没有发生变化，这里说的是必须是静止质量，不然这个问题没法回答。因为质量不是物质的固有属性。物质要获得恒定加速度的力与质量之间不是线性关系。牛二定律仅适用于宏观世界。运动质量和物质的运动速度有关。
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就目前的科技水平而言，认为你这个反应是没有质量损失的，但是有能量变化，燃烧反应是放热反应，热量以辐射的方式散发了。
但是，如果我较真一点，我觉得辐射出去的热量就是损失的质量，只是这个质量很小很小，我们现在不把它定义为质量而已。