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新生儿的代偿能力很强，如果是轻度的神经损伤，孩子会完全恢复，不留下后遗症；中度的神经损伤大约30%会有后遗症，一般孩子有明显的神经系统症状、电生理改变。重度的损伤都会留下后遗症。所以对于有新生儿窒息史的孩子都需要定期随访，做好早期干预。
后遗症主要涉及五大系统：中枢神经、心血管、呼吸系统、泌尿系统、消化系统
1.中枢神经系统损害
窒息后脑损害的主要表现是缺氧缺血性脑病（HIE）和颅内出血（ICH）。
HIE 和 ICH 是新生儿期危害最大的常见病，常引起新生儿的死亡和其神经系统的发育障碍。
缺氧时非重要的生命器官血管收缩，可使胎儿或新生儿的大脑在轻度缺氧时不受损伤，随者缺氧程度的的进展，脑血管的自主调节功能被破坏，形成压力被动性脑血流，当血压降低时就可造成动脉边缘带的缺血性损害，发生缺氧缺血性脑病，足月儿最易累及的部位是矢状旁区，早产儿主要发在脑室周围的白质；而当外周血压增高时，又有发生颅内出血的危险，常见的为早产儿脑室周围生发基质-脑室内出血（GMN-IVH）。
2.心血管系统损害
窒息所致缺氧缺血可致心肌细胞的能量代谢发生障碍、ATP 耗竭，导致心肌的损害；同时持续的缺氧可导致肺循环压力和阻力的增高，右心室后负荷的增加，氧耗增加，从而加重冠状动脉供血的心内膜下心肌和左室右壁的心肌缺血。
缺氧缺血性心肌损伤的病理表现主要为心肌细胞的坏死，特别是心内膜下及乳头肌心肌细胞的坏死；程度较轻者呈心肌充血，伴心肌细胞内空泡形成和横纹的消失。
窒息后心肌损害的临床表现多样，轻度则表现为暂时性呼吸困难或无明显临床症状，重症表现为青紫、呼吸急促和或心力衰竭。
X 线检查可发现心脏扩大，肺部的充血表现。心电图改变与窒息严重程度相一致，轻度窒息者心电图可仅表现为非特异性的 T 波改变，重度窒息者可见典型的心肌梗死改变。常规心电图ST-T 缺血性改变作为判断心肌缺血的指标具有较高的特异性，24 小时动态心电图的应用可弥补常规心电图的不足，提高心肌损害诊断的敏感性。QT 离散度用于评价新生儿缺氧缺血性心肌损伤较心肌酶谱敏感，更具有特异性，且可用于治疗效果的评价 。彩色多普勒超声心动图对于诊断新生儿缺氧缺血性心肌损害有着较高的敏感性和特异性，表现为二、三尖瓣高速反流，左、右心室的收缩和舒张功能均明显的减退，肺动脉压力增高和石壁运动的异常。此外生化指标的测定对心肌损害的判断有一定的价值，目前较为常用的有肌酸激酶（CK）和肌酸激酶心肌同工酶（CK-MB）和心肌肌钙蛋 I﹙CTn-I﹚等。
3.呼吸系统损害
窒息对呼吸系统的损害主要表现有胎粪吸入综合征（MAS），持续性肺动脉高压（PPHN），呼吸衰竭与肺出血。
①胎粪吸入综合征：宫内窒息可致低氧血症和高碳酸血症发生，刺激呼吸中枢，使胎儿发生深呼吸，引起胎粪排出MAS，部分 MAS 患儿呼吸困难，紫绀加重，提示可能并发了气漏。
②持续肺动脉高压和呼吸衰竭：窒息后肺动脉血流量减少，肺血管内皮受损，内皮素水平增高使肺血管与支气管平滑肌收缩，肺的毛细血管压及通透性增加而发生肺水肿和 PH。PH 还可使血氧浓度继续下降最终导致呼吸衰竭，PH 还可影响心功能。
③肺出血：肺出血是窒息缺氧最严重的并发症之一，多见于生后的第一天内，由于缺氧后的心肌损害导致急性出血性肺水肿，表现有呼吸困难加重﹑三凹征﹑青紫、肺部出现细湿罗音，口鼻溢出血性液体等。组织缺氧缺血后程度加重，使肺小血管痉挛，肺血流减少，肺弥散功能减少，加重缺氧和酸中毒，形成恶性循环，也可加重肺损害。有研究表明，缺氧后 PS 生成减少，可发生急性呼吸窘迫综合征（ARDS）。因此，肺损伤也是新生儿窒息死亡的主要原因之一。
4.泌尿系统损害
窒息后肾脏功能损伤也较为常见，窒息时体内血循环即出现了一系列改变，肾脏的血流灌注不足，luciano 等采用多普勒技术监测窒息新生儿的肾脏血流动力学，发现肾血流的平均流速、收缩流速均明显的下降。缺氧使血栓素 A2﹙TXA2﹚的产生增多，导致肾皮质和髓质血细胞的聚集与血管收缩，血管紧张素的活性增强使肾小动脉收缩，肾皮质的血流减少，肾小球的滤过率及尿量降低。
有学者提出窒息的患儿可有肌红蛋白尿，肌红蛋白对肾脏的毒性作用可自轻微肾小管损害到严重的肾衰竭。窒息引起的功能损害的轻重程度不一，绝大多数是可逆性的改变。肾小管损伤时可见尿蛋白与管形，肾静脉栓塞时可出现肉眼血尿和高血压，长期尿闭者可出现充血性心功能衰竭。由于在临床上普遍未认真測量新生儿的尿量，少尿症状易被忽视。临床上常以氮质血症及和血肌酐升高作为肾功能障碍的指标，但是敏感性不够高，会遗漏不少隐匿损害者。近些年来，普遍的认为測定 β2 微球蛋白够敏感地检出肾小球滤过率下降﹙血 β2 微球蛋白升高﹚及肾小管的重吸收功能障碍﹙尿 β2 微球蛋白升高﹚，从而提高了窒息后肾功能损害的检出率，N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶﹙NAG﹚对肾小管功能损害的检出也有意义，其敏感性高，多数患儿可无少尿、无尿和氮质血症的表现。
5.消化系统损害
窒息后由于胃肠道缺血、缺氧可引起功能性和器质性的损伤。
①应激性溃疡：缺氧、缺血可导致胃粘膜糜烂或溃疡，发生呕血和便血。
②喂养不耐受：喂养不耐受与窒息影响胃肠道的动力有关。研究表明，在空腹时窒息患儿的移动性运动复合波（migrating motor complex,MMC）比非窒息的儿少，静止期相对较多，但持续的时间短，幅度低，这些表现与早产儿的动力相似。进食后窒息儿与非窒息儿的动力均发生变化，但前者的反应更快，这与窒息儿暂时失去了肠道动力的抑制性控制有关。第一周内所有的窒息儿均不耐受喂养，但两周以后窒息儿的动力活动如 MMC、成簇波收缩发生数和非窒息儿的相仿，这说明窒息对肠道动力的影响是暂时的。③新生儿坏死性小肠结肠炎（NEC）：缺氧是NEC 发生的主要原因之一，缺氧后机体发生了潜水反射，肠系膜的血管强烈收缩，因而导致肠粘膜的缺血损伤，肠粘膜因缺氧缺血性损伤而有利于侵入性细菌的繁殖，从而，轻症出现胃肠道动力紊乱，严重者引起肠粘膜的坏死。临床表现为腹胀、呕吐与便血等，X 线表现有助诊断。
④肝功能损伤和新生儿胆汁淤滞（cholestasis）：窒息后缺氧缺血可导致肝细胞损伤，SGOT 和 SGPT 的升高，肝脏肿大。也有窒息可导致新生儿胆汁淤滞的报道，随访其肝功能大多能恢复正常。缺氧后肝功能损伤也可致高氨血症，临床上以中枢神经系统异常为主，如激惹﹑抑制﹑昏迷，可伴发体温升高和高血压等。
儿科医生鲍秀兰
在产房，我们对于刚出生的新生儿会进行阿氏评分，这种阿氏评分主要是评估新生儿出生时无窒息及窒息严重程度的一种方法。
具体步骤是：在婴儿出生后1、5、10分钟，我们会分别对新生儿得呼吸、心率、肌张力、皮肤颜色、喉反射等五项指标进行评分。每项0-2分，满分为10分。如五项总分0-3分为重度窒息，4-7分为轻度窒息，8-10为无窒息。
具体谈到新生儿窒息有无后遗症的问题，一般来说，重度窒息的后遗症影响最大，主要会引起新生儿的大脑缺血、缺氧。导致孩子智力、情绪、活动能力、行为能力异常。窒息时间越长，程度越严重。甚至出现脑瘫。\n 不过，新生儿出生时的窒息大部分是轻中度，主要的影响是短时间的呼吸、神经反射减弱。肤色青紫。及时吸氧和提高耐缺氧治疗可以很快恢复，不会留下什么后遗症。