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2、由于长期使用泼尼松等糖皮质激素会降低机体防御能力，使用过程中可以降低患者的免疫能力，所以可能会加重病原微生物的感染。
3、长期使用糖皮质激素后，可能会出现反跳现象的发生。特别是突然停止使用药物后，会加重原有疾病的症状。
4、消化系统的损伤，主要是由于糖皮质激素可以刺激胃酸或胃蛋白酶的分泌，降低胃蛋白酶对胃酸的抵抗力，可出现甾体激素溃疡。
5、长期使用后也会导致水钠潴留，血脂升高，可能引发高血压或动脉粥样硬化。
6、由于可以抑制生长激素的分泌，还可以影响儿童的正常发育，孕妇妊娠三月，使用泼尼松等糖皮质激素可能造成胎儿畸形。