英勇善戰的法老（國王）圖特摩斯一世與王后雅赫摩斯只有一個女兒哈特謝普蘇特，他的其餘幾個兒子都是非王族出身的妃子們所生。按照王室的傳統，法老偏出之子必須同王后的女兒結婚，才能取得合法的繼承地位。
公元前1512年，圖特摩斯一世去世。他的長子承襲父名，繼位稱圖特摩斯二世。此前，圖特摩斯二世已同哈特謝普蘇特結婚，生有兩個女兒。
哈特謝普蘇特從小就有著和父親一樣的稟性，她聰明機智、性格堅強，常以埃及真正的王室繼承人自詡，從不把同父異母的兄弟們放在眼裡。確切地說，從18歲開始，她就設想有朝一日要統治整個埃及。
圖特摩斯二世體弱多病，疾病的折磨使他難得有興趣過問政治。因此從他繼位之始，哈特謝普蘇特就牢牢地控制著丈夫，把大權掌握在自己手中。圖特摩斯在王位上只待了幾年就病死了。緊接著，王室內為爭奪王位展開了較量。
哈特謝普蘇特自己沒有生過兒子，但又不願看到圖特摩斯二世其他妃子生的兒子與自己的女兒結婚，然後來佔據她父親傳下來的王位。當時王后身邊雖然有一群親信，可是她在宮廷中的根基卻仍然不穩，僧侶、王室和宮廷結成了一股可怕的勢力企圖阻止她掌權。儘管有關事態發展的文字記載已蕩然無存，但可以想象，當時的鬥爭相當激烈。後來的事實表明，哈特謝普蘇特沒有被擊敗，她與先王手下以維護傳統為己任的朝臣和阿芒神廟的僧侶達成協議，由圖特摩斯二世偏出之子、一個也叫圖特摩斯的10歲男孩繼位，哈特謝普蘇特以姑母的身份擔任攝政。
為了進一步控制年幼的法老，哈特謝普蘇特讓他與自己的女兒涅菲魯勒訂婚，並把他與朝臣們隔絕開來。攝政王親自管理國家事物，一點也不讓那個可憐的男孩插手。這一時期的銘文中，哈特謝普蘇特的名字與法老的名字連在一起。
圖特摩斯三世雖然只是名義上的法老，但他總有成年之時，前朝舊臣也總有一天會對他施加影響，將他推上政治舞臺。女攝政王清楚地意識到這一點，於是就趕在法老成年之前，把他流放到卡納克，讓他在阿芒廟中當了僧侶。公元前1503年，哈特謝普蘇特取得法老的標誌、徽章、服裝和其它象徵物，正式加冕為法老。
哈特謝普蘇特頭像
在哈特謝普蘇特之前，埃及人還從未看見過一位婦女當朝，以往由法老主持的各種儀式，如某些潔身儀式等，對於女性來說也很不方便。為了能象其他法老一樣行使權力，女法老克服了重重困難。她身著男裝，戴上假鬍鬚，用男性代名詞稱呼自己，並借一切機會強調自己的合法地位。她還編造身世，說自己是太陽神阿芒之女，這就是人們在尼羅河西岸的哈特謝普蘇特神廟牆壁上看到的嬰兒降生浮雕。浮雕所敘述的是一個神話故事：
太陽神阿芒為了從自己身上產生一位埃及統治者，就裝扮成圖特摩斯一世的模樣來到雅赫摩斯王后的臥室，王后錯把他當成丈夫與之同床共枕。不久王后懷孕，在眾女神的照料下生下一個女兒。阿芒神承認這個孩子是自己的女兒，並讓她繼續生活在埃及宮廷裡，以便將來統治埃及。
哈特謝普蘇特用這個故事來反擊她的政敵，告訴他們，她是偉大的阿芒神的骨肉，繼承王位理所當然；同時又宣稱圖特摩斯一世早就宣佈她為法老。
作為至高無上的女法老，哈特謝普蘇特竭力維護和平，而不象埃及同朝其他法老那樣熱衷於戰爭。她還非常重視改革行政管理制度和發展商業，曾派遣船隊遠航蓬特，滿載而歸。歷史事實表明，女法老確實是一位卓越的政治家和有能力的統治者。當時的一位埃及廷臣就曾說過：“她能夠按照自己的願望管理國家事務。”
外族人入侵時期，埃及許多古老的建築遭到破壞，哈特謝普蘇特在重視修復這些代表埃及古代精神的建築的同時又大興土木，建起各種富麗堂皇的祠廟和紀念物，並重建了城鎮。她沒有忘記為自己修建一座陵墓，甚至還一度計劃把父親的木乃伊移入自己的墓內，以鞏固自己的地位。女法老時期最有名的建築是提埃爾巴利神廟，它的總建築師孫漠特是一位朝氣蓬勃、才華橫溢的年輕人。據說孫漠特也是女法老的情人，他們終生相愛，最後一同失蹤。
哈特謝普蘇特任命孫漠特掌管她的私人莊園，以後又提拔他為相當於首席大臣的阿芒神最高祭司。孫漠特還擔任法老女兒的家庭教師，並直接為女法老出謀劃策。
埃及的神廟顯貴構成了國家的一支重要力量，女法老為了獲得他們的支持修復了埃及所有殘破的神廟，向國家神廟贈送了4個高30米、用整塊石材雕成的方尖碑，還吟詩作賦獻給阿芒神。許多神廟僧侶成為國家官員，孫漠特就是其中之一。但是女法老恰恰忽視了軍隊和將領們的作用。哈特謝普蘇特執政17年後，其統治地位受到觸動。此時在阿芒神廟中擔任祭司的圖特摩斯三世，避開女法老密使的監視，在僧侶們的幫助下，與軍隊將領們取得了聯繫。他向將領們保證，軍隊長年無所作為的情況將會結束，他們會受到重視和晉升。長大成人的圖特摩斯掌握了軍權，勢力日益強大，同時他還在全國各地製造不滿情緒。女法老意識到威脅，開始採取一切手段維護王位，但為時已晚。公元前1482年的一天，哈特謝普蘇特突然神秘地失蹤，同時失蹤的還有她的女兒和寵臣孫漠特。
女法老的失蹤引起一連串疑問，她是被殺、還是被囚禁？女法老的支持者都在哪裡？為什麼沒有關於這次宮廷政變的任何記錄？人們猜測了3000多年，也只知道一點，就是女法老沒有被葬在國王谷中她的陵墓裡，那裡沒有她的木乃伊。
圖特摩斯三世繼位後的第一件事，就是派人跑遍全國，把女法老的名字從石碑銘文中抹掉，還把她建在卡納克神廟的方尖碑用磚牆遮擋起來。提埃爾巴利神廟內的女法老石雕像被燒燙後，又澆上冷水任其炸裂，石雕碎塊最後被扔進廟旁的石坑中。圖特摩斯三世宣佈哈特謝普蘇特的當朝為非法，而把自己復位的那一年算為自己朝代的第22年。
重新得勢的圖特摩斯三世企圖一勞永逸地消除女法老的所有痕跡，但歷史卻無情地嘲弄了他。如今哈特謝普蘇特的方尖碑幾千年來由於磚牆的保護而完好無損，可是他自己的方尖碑卻因風吹雨打字跡難辨。
哈特謝普蘇特女王神殿
20世紀80年代，考古學家們發現了據說是女法老的木乃伊。這具木乃伊究竟是不是哈特謝普蘇特本人，還有待於專家們作進一步鑑定。如果答案肯定，那麼揭開女法老失蹤這個千古之謎的日子就為時不遠了。
