Nature的最新研究,重新揭示苯的電子結構

1864年冬的某一天,德國化學家凱庫勒坐在壁爐前打了個瞌睡,原子和分子們開始在幻覺中跳舞,一條碳原子鏈像蛇一樣咬住自己的尾巴,在他眼前旋轉。猛然驚醒之後,凱庫勒明白了苯分子是一個環——就是現在充滿了我們的有機化學教科書的那個六角形的圈圈。

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教科書中寫道:苯分子裡6個碳原子都以sp2雜化方式分別與2個碳原子形成碳碳σ鍵、與1個氫原子形成碳氫σ鍵。另外苯環上6個碳原子各有1個未參加雜化的2p軌道,他們垂直於環的平面,相互平行重疊形成大π鍵。因為大π鍵的存在,苯的結構更加的穩定。但是苯分子到底是什麼樣的電子結構,科學界一直以來有很大的爭議。

Nature的最新研究,重新揭示苯的電子結構

2020年3月5日,國際頂級期刊《Nature》的子刊《Nature Communications》在線發表了題為“The electronicstructure of benzene from a tiling of the correlated 126-dimensional wavefunction”的研究文章,採用理論框架(包括軌道理論)獲得化學層面的數據,應用DVMS在126個維度下繪製波函數,成功揭示了苯的電子結構。通訊作者和通訊單位分別是悉尼新南威爾士大學ARC傑出科學中心的Timothy W. Schmidt和堪培拉大學的Terry J. Frankcombe。

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研究預覽

苯的電子結構是各種電子結構觀點的練兵場,其中價鍵理論將電子定位在疊加共振結構中,而分子軌道理論描述了離域電子。但是,從軌道的角度來解釋電子結構,忽略了在同類自旋交換時,波函數是反對稱的;此外,分子軌道並不能直觀地描述電子間的相互關係。

在此文章中,該團隊證明了苯的126維電子波函數可以通過相似自旋的排列被分割成若干塊。利用相關的波函數,這些磁瓦被投射到每個電子的三個維度上,以揭示凱庫勒結構的疊加。但是,相反的自旋有利於交替使用凱庫勒結構。這一結果簡明扼要地描述了苯中電子關聯的主要作用,並強調當能量上有利地避免電子間的相互作用時,電子將不會在空間上成對。

內容詳解

六元環芳香族化合物,普遍存在於生物界中,他們是DNA和蛋白質的重要組成部分。苯是典型的芳香族分子,與其他不飽和烴相比,具有特殊的化學穩定性。1825年法拉第第一次報道了它,自此之後它的電子結構已經被討論了一個多世紀。凱庫勒提出了許多結構公式,其中最令人滿意的是單鍵和雙鍵交替的結構,然而,這種結構並不具備滿足實驗證據所要求的六倍對稱性。為了解釋這一點,凱庫勒提出了這些結構之間的振盪,儘管他對電子或量子力學一無所知。

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苯的DVMS結構

1897年電子的發現促使劉易斯在1902年提出了雙電子化學鍵,儘管這個想法直到1916年才發表。隨著量子力學的引入,鮑林證明了兩個具有相同能量的凱庫勒結構會產生共振,從而產生更低的能量形式。赫克爾提出了一種不同的方法,電子將佔據分子軌道(MOs),在多個原子中心離域。

隨著化學電子結構理論在隨後幾十年的發展,在分子軌道方法(MO)和價鍵理論(VB)之間產生了競爭。前者強調簡單的計算;後者則重在化學知識的直覺。一直以來化學教科書中提到的σ——π結構是一種比較好的解釋苯的結構,被認為是凱庫勒比分子軌道更加切合真實情況。經過充分的計算,科學界早就認為,MO方法和VB方法收斂於對電子結構的相同描述,因此它們與計算形式一樣有效。總的來說,MO方法被認為更加的合適,畢竟計算比較簡單。

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用DVMS分析波函數

該團隊報道了一種識別和可視化波函數塊的方法,這個過程被稱為dynamic Voronoi Metropolis sampling (DVMS),它使用迭代算法來識別由節點描繪的三維空間中的區域,在不同符號塊之間有邊界的情況下,在相似符號塊的情況下使用Voronoi圖。DVMS程序複製了諸如核心電子、單鍵、多鍵(香蕉型)和孤對電子等基序,該方法的唯一輸入是正確的反對稱性波函數,因此與理論方法無關。

在本文的工作中,該團隊使用DVMS程序重新研究了苯的電子結構,結果發現,一個單行列式波函數可以複製凱庫勒結構,但當兩個自旋集同時存在時,它們對凱庫勒結構和凱庫勒結構的位置是不確定的。

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採樣法分析波函數

每個自旋的電子在碳之間交替地單鍵或雙鍵,符合凱庫勒結構。為了表示波函數的範圍,它可以被橫切:波函數的等值面在每個電子的維度上被繪製出來,依次在Voronoi位點上保持其他電子,這導致了圖1b所示。每個藍色的波瓣表示每個C-C成鍵電子的範圍,而C-H成鍵電子用灰色表示。

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重疊和交錯凱庫勒結構的平衡總體

本質上,電子對通過彼此的電子相互排斥,降低分子的能量,從而更穩定。當能量上能避免電子間的相互作用時,電子將不會在空間上成對。正是通過允許電子去偶,相關效應才得以顯現。如苯,更傾向於形成電子密度均勻分佈於碳-碳鍵之間的交錯凱庫勒結構。

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苯共振圖示

在交錯構象中,每個碳-碳鍵區域有3個電子,但在重疊構象中,其中3個碳-碳鍵含4個電子,3個碳-碳鍵含2個電子。在21種構象中,53%是交錯型的。更重要的是該團隊發現自旋向上的電子是雙鍵,而自旋向下的電子是單鍵。凱庫勒結構隱藏在反對稱分子軌道波函數中,自旋不配對和交錯構象的存在是關鍵。



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