理論計算系列在線課程:第一性原理、量化、MD模擬、鈣鈦礦、裝機配置

隨著科技的進步,理論計算已經成為科研中越來越重要的一環。可是計算學習門檻比較高,沒有人帶入門,在遍地是坑的計算領域很難前進。為了解決大家學習理論計算困難的問題,讓大家不出門就能得到高質量教學和答疑服務。庚子計算推出系列理論計算課程第一彈:

  • 第五屆「固體與表面」理論計算初級班(線上班)


  • 量子化學計算入門

  • MD模擬:LAMMPS軟件在金屬材料中的應用

  • MD模擬:GROMACS 基礎與自由能計算

  • 鈣鈦礦材料電子結構、光學性質、力學性質計算以及常見雷區分析

  • 高性能計算平臺配置指南

歡迎更多理論計算工作者聯繫我們一起,以直播的形式把您的知識分享給大家,即傳播了知識,又收穫豐厚報酬。

關於課程內容相關疑問,請在評論區留言,我們會統一回答。

課程簡要介紹

MD模擬:GROMACS 基礎與自由能計算專題課程

主講人:裴老師 (天津大學,精通GROMACS、 Gaussian、 Multiwfn、 VMD/Mercury、 packmol/MS等計算程序。)

直播時間:2020 年3月7日、9號 19:30(一共 2 次課,每次 2 - 3h)

費用:199元

內容介紹:

一、主要方法概述,Gromacs簡介,分子動力學模擬原理簡介,力場文件生成,輸入文件詳解,計算結果分析。

二、自由能微擾FEP方法,實例:水中甲烷溶解自由能的計算

三、熱力學積分TI方法,實例:蛋白配體複合物的結合自由能

四、傘狀採樣US方法,實例:單個多肽從原絲纖維生長端的分離

五、MMPBSA方法,實例:蛋白配體複合物的結合自由能分解

課後答疑

各種方法講解的思路如下:

  • 基本原理思想

  • GROMACS中的計算流程

  • 相關文件及命令解釋

  • 教程運行演示

  • 示例結果說明

鈣鈦礦材料電子結構、光學性質、力學性質計算以及常見雷區分析

主講人:唐老師(比利時列日大學博士後。目前是多個理論計算平臺(學術之友微信公眾號、DFT 計算之家 QQ 群等)的運營者,關注粉絲量超過萬人。主要從事偏固體物理方向的理論計算。其中第一作者論文發表在 J. Phys. Chem. Lett.,J. Mater. Chem. C 等國際期刊上,具有多次線下軟件安裝和計算培訓的經驗,培訓學員超過 300 人。)

費用:99元

課程時間:2020年03月14日19:30 (時長 2 - 3h )

內容介紹:

以鈣鈦礦材料為例,結合典型文獻,著重剖析這些計算常見雷區,講解:

  • 電子結構

  • 光學性質

  • 力學性質計算

量子化學計算入門

主講人:倪老師 (美國阿肯色大學、南京大學博士,八年量子化學計算研究經驗,長期從事量子化學後HF方法的理論發展和程序開發與應用,在JCTC,JCC等頂尖理論計算專業期刊發表多篇論文)

課程時間:2020年3月4號,6號,8號 19:30(3次課,每次2-3h)

費用:299元

內容介紹:

一、緒論

二、常見量子化學方法簡介與常見計算類型實例講解

  • Hartree-Fock方法

  • 半經驗方法

  • 微擾方法

  • 耦合簇方法

  • 密度泛函理論、色散校正

  • 基組中的常見概念及基組文件介紹

  • 常見類型的基組

  • 量子化學計算中方法、基組的選擇

  • 建模軟件與可視化程序介紹

  • 勢能面的概念及勢能面掃描

  • 能量極小點優化

  • 過渡態優化

  • IRC分析

  • 頻率計算、振動分析、熱力學量計算

MD模擬:

LAMMPS軟件在金屬材料中的應用

主講人:魏老師(武漢大學博士,在核材料頂級期刊 journal of nuclear material 以及nuclear fusion上發文,並與實驗合作在acta material上發文。同時運營“Lammps愛好者”公眾號,原創30多篇lammps學習教程,有非常豐富的lammps使用教學經驗,擔當lammps線下講師。)

課程時間:2020年3月2號 19:30 開講(時長約 2 - 3h)

費用:99 元

內容介紹:

  1. LAMMPS軟件簡介(瞭解)

  2. LAMMPS軟件使用框架(學習)

  3. LAMMPS經典實例介紹(實踐)

  4. LAMMPS軟件在聚變材料界的應用(應用)

高性能計算平臺配置指南

主講人:王老師 (吉林大學,十年理論計算化學研究經驗和服務器運維經歷,自己搭建和幫助課題組企業搭建高性能計算服務器,精通高性價比服務器和集群配置方案,多次線上授課經驗。)

課程時間:2020年3月1日晚19:30(時長:2 - 3h)

費用:99元

內容介紹:

• 相關概念介紹

• 機器配置推薦

• 系統部署建議

• 軟件部署建議

特別說明 本課程假設用戶會一點點linux指令行使用,如有演示操作,將會在Ubuntu18.04 桌面版進行。本課程不涉及Linux操作相關部分的教學。

• CPU密集型計算

• 讀寫密集型計算

• 並行計算與效率,附帶GPU的並行計算

• 多線程共享內存並行

• 多節點分佈式並行計算 • 存儲

• 讀寫緩存

• 塔式、機架式, 雙路、四路服務器

• 計算服務器配置原則與通用配置建議(結合預算考慮)

• 硬盤與分區考慮

• Linux系統安裝設定

• 系統初始化設定 系統組件安裝

• 示例Gaussian16安裝

服務器+計算教學服務

想做計算,但是沒有機器/不會裝軟件/不會用軟件/不會提交任務/不會後處理分析。怎麼辦?

別急,庚子矩陣一站式服務器,幫您解決計算科研中的所有問題!開箱插電即用, 系統/隊列/軟件配置齊全, 遠程屏幕共享操作教學, 程序報錯解決, 軟件使用一對一教學等。

加客服微信(微信號:ccl2098)獲取詳細信息:

理论计算系列在线课程:第一性原理、量化、MD模拟、钙钛矿、装机配置


分享到:


相關文章: