随着科技的进步,理论计算已经成为科研中越来越重要的一环。可是计算学习门槛比较高,没有人带入门,在遍地是坑的计算领域很难前进。为了解决大家学习理论计算困难的问题,让大家不出门就能得到高质量教学和答疑服务。庚子计算推出系列理论计算课程第一弹:
第五届「固体与表面」理论计算初级班(线上班)
量子化学计算入门
MD模拟:LAMMPS软件在金属材料中的应用
MD模拟:GROMACS 基础与自由能计算
钙钛矿材料电子结构、光学性质、力学性质计算以及常见雷区分析
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高性能计算平台配置指南
欢迎更多理论计算工作者联系我们一起,以直播的形式把您的知识分享给大家,即传播了知识,又收获丰厚报酬。
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课程简要介绍
MD模拟:GROMACS 基础与自由能计算专题课程
主讲人:裴老师 (天津大学,精通GROMACS、 Gaussian、 Multiwfn、 VMD/Mercury、 packmol/MS等计算程序。)
直播时间:2020 年3月7日、9号 19:30(一共 2 次课,每次 2 - 3h)
费用:199元
内容介绍:
一、主要方法概述,Gromacs简介,分子动力学模拟原理简介,力场文件生成,输入文件详解,计算结果分析。
二、自由能微扰FEP方法,实例:水中甲烷溶解自由能的计算
三、热力学积分TI方法,实例:蛋白配体复合物的结合自由能
四、伞状采样US方法,实例:单个多肽从原丝纤维生长端的分离
五、MMPBSA方法,实例:蛋白配体复合物的结合自由能分解
课后答疑
各种方法讲解的思路如下:
基本原理思想
GROMACS中的计算流程
相关文件及命令解释
教程运行演示
示例结果说明
钙钛矿材料电子结构、光学性质、力学性质计算以及常见雷区分析
主讲人:唐老师(比利时列日大学博士后。目前是多个理论计算平台(学术之友微信公众号、DFT 计算之家 QQ 群等)的运营者,关注粉丝量超过万人。主要从事偏固体物理方向的理论计算。其中第一作者论文发表在 J. Phys. Chem. Lett.,J. Mater. Chem. C 等国际期刊上,具有多次线下软件安装和计算培训的经验,培训学员超过 300 人。)
费用:99元
课程时间:2020年03月14日19:30 (时长 2 - 3h )
内容介绍:
以钙钛矿材料为例,结合典型文献,着重剖析这些计算常见雷区,讲解:
电子结构
光学性质
力学性质计算
量子化学计算入门
主讲人:倪老师 (美国阿肯色大学、南京大学博士,八年量子化学计算研究经验,长期从事量子化学后HF方法的理论发展和程序开发与应用,在JCTC,JCC等顶尖理论计算专业期刊发表多篇论文)
课程时间:2020年3月4号,6号,8号 19:30(3次课,每次2-3h)
费用:299元
内容介绍:
一、绪论
二、常见量子化学方法简介与常见计算类型实例讲解
Hartree-Fock方法
半经验方法
微扰方法
耦合簇方法
密度泛函理论、色散校正
基组中的常见概念及基组文件介绍
常见类型的基组
量子化学计算中方法、基组的选择
建模软件与可视化程序介绍
势能面的概念及势能面扫描
能量极小点优化
过渡态优化
IRC分析
频率计算、振动分析、热力学量计算
MD模拟: LAMMPS软件在金属材料中的应用
主讲人:魏老师(武汉大学博士,在核材料顶级期刊 journal of nuclear material 以及nuclear fusion上发文,并与实验合作在acta material上发文。同时运营“Lammps爱好者”公众号,原创30多篇lammps学习教程,有非常丰富的lammps使用教学经验,担当lammps线下讲师。)
课程时间:2020年3月2号 19:30 开讲(时长约 2 - 3h)
费用:99 元
内容介绍:
LAMMPS软件简介(了解)
LAMMPS软件使用框架(学习)
LAMMPS经典实例介绍(实践)
LAMMPS软件在聚变材料界的应用(应用)
高性能计算平台配置指南
主讲人:王老师 (吉林大学,十年理论计算化学研究经验和服务器运维经历,自己搭建和帮助课题组企业搭建高性能计算服务器,精通高性价比服务器和集群配置方案,多次线上授课经验。)
课程时间:2020年3月1日晚19:30(时长:2 - 3h)
费用:99元
内容介绍:
• 相关概念介绍
• 机器配置推荐
• 系统部署建议
• 软件部署建议
特别说明 本课程假设用户会一点点linux指令行使用,如有演示操作,将会在Ubuntu18.04 桌面版进行。本课程不涉及Linux操作相关部分的教学。
• CPU密集型计算
• 读写密集型计算
• 并行计算与效率,附带GPU的并行计算
• 多线程共享内存并行
• 多节点分布式并行计算 • 存储
• 读写缓存
• 塔式、机架式, 双路、四路服务器
• 计算服务器配置原则与通用配置建议(结合预算考虑)
• 硬盘与分区考虑
• Linux系统安装设定
• 系统初始化设定 系统组件安装
• 示例Gaussian16安装
服务器+计算教学服务
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