Bio-Rad發佈全球首款數字PCR一體機:QX ONE ddPCR

聚合酶鏈式反應 ( polymerase chain reaction,PCR) 提出至今已有20年時間,期間PCR已發展成為分子生物學領域的一項關鍵技術和常規技術,極大地推動了生命科學各個領域的發展。PCR技術自問世以來,在遺傳病、病原體、癌基因等分子診斷領域和法醫鑑定等方面發揮了巨大作用。

新品速遞 | Bio-Rad發佈全球首款數字PCR一體機:QX ONE ddPCR

QX ONE ddPCR系統

90 年代後期,美國 ABI 公司推出的實時熒光定量PCR( real time PCR,qPCR) 技術及相關產品更是將PCR由體外合成及定性/半定量檢測技術發展成為一種高靈敏、高特異性和精確定量的基因分析技術。20 世紀末,美國約翰·霍普金斯大學Ludwig中心聯合主任Kenneth Kinzler與同事Bert Vogelstein一起首先提出了“數字PCR”(digital PCR,dPCR) 的概念,將分析帶入了絕對定量時代。

如今,ddPCR技術已經應用在多個方面,包括定量癌症標誌物、測定病毒載量、區分基因組變異、驗證新一代測序的結果、基因表達分析、轉基因檢測以及環境監測等等。此外,您還可以利用ddPCR技術來檢驗CRISPR/Cas9的基因組編輯效果。

目前市場主流的三家數字PCR系統:

1、賽默飛世兒的3D數字PCR(芯片式數字PCR),主要是將20ul反應體系分散到20000個微孔中進行反應,變成20000個反應體系,PCR反應結束後,採用CCD拍照,數陽性反應孔。

2、Bio-Rad的微滴數字PCR(油包水原理):將20ul反應體系採用液滴反應器形成20000個油包水反應體系,PCR反應結束後,才有流式細胞術的原理,檢測每一個液體,數陽性反應的液滴數量。

3、RainDance 的數字PCR(油包水原理)、原理與伯樂微滴數字PCR相同,但是其液體形成能力比伯樂強很多,理論上可以產生1000萬個小油滴。

相對於熒光定量PCR(qPCR)而言,dPCR具備以下優勢:

  1. 無需依賴參考物或標準品
  2. 通過使用更多PCR複製物能夠提高精確度
  3. 對抑制劑具有較高耐受性
  4. 能夠分析複雜混合物
  5. 對較小倍數改變的線性檢測

實時熒光定量 PCR、傳統 PCR 與數字 PCR 概述

新品速遞 | Bio-Rad發佈全球首款數字PCR一體機:QX ONE ddPCR

圖片來自賽默飛官網

目前Bio-Rad推出了全新的QX ONE ddPCR 系統將ddPCR工作流程無縫整合成一體化設備,使其成為實驗室中優化流程、擴大生產和發展業務的理想夥伴。此次即將推出的QX ONE系統將Bio-Rad的微滴式數字PCR(ddPCR)技術集成在單臺自動化儀器中,適用於藥物開發和生產質控,以及其他關鍵的檢測環境。

高通量全自動ddPCR檢驗應用方案

QX ONE ddPCR系統整合了微滴生成、熱循環反應及微滴讀取等步驟,最大程度減少人工操作,提高了實驗通量。配備四個獨立的熒光檢測通道,結合ddPCR特有的高階多重PCR技術,可以在單反應孔中實現8重拷貝數變異(CNV)檢測、5重突變檢測或4重基因表達檢測。兼容目前QX200 系統中所使用的supermix、assay和kit。

QX ONE ddPCR系統實驗流程

新品速遞 | Bio-Rad發佈全球首款數字PCR一體機:QX ONE ddPCR

QX ONE ddPCR系統實驗流程

QX ONE ddPCR 系統的性能特點

新品速遞 | Bio-Rad發佈全球首款數字PCR一體機:QX ONE ddPCR

QX ONE ddPCR 系統的性能特點

本文資料主要參考自:伯樂與賽默飛世兒官方網站

關注基因狐、一起走進生命科學


新品速遞 | Bio-Rad發佈全球首款數字PCR一體機:QX ONE ddPCR


分享到:


相關文章: