动物粪便可不可以作为有机肥料呢？这个看似简单的问题其实很复杂。动物粪便，目前主要是畜禽粪便，如果从其产生过程及氮、磷、钾养分有效含量来说，确实是有机肥；但规模化养殖场的畜禽粪便含有大量抗生素与重金属，这样来看又不可以简单地作为有机肥料直接施用。
在菜市场，经常可以听到卖菜人这样标榜自己的产品：“我的这菜用得可都是鸡场的鸡粪，一点化肥也没用，纯粹的有机食品。”在生活中，这样的话我们会听到而且也会相信。同样是畜禽粪便，在农民眼中是劲头儿十足的有机肥，在专家眼中却是避之不及的有害物质。其实说起来也简单，一家一户小规模散养时确实是“肥粪一家”，但时过境迁，现在规模养殖场已经成为畜禽养殖的主流，饲料添加剂大量使用甚至超量使用，如果把未经处理的畜禽粪便直接当作肥料，不但种出的不是有机作物，还会给作物、土地带来意想不到的危害。
就拿鸡粪来说，尽管由于鸡的生理结构使得其粪便在所有禽畜粪便中养分最高、最全面，是有机肥生产的理想原材料，但如果未经充分发酵或腐熟而直接施用到作物上，则存在几大害处：第一就是鸡粪中含有大肠杆菌、线虫等病菌和害虫，直接使用会传播病虫害，导致作物发病，对食用农产品的人体健康也产生影响；
第二是发酵产生的热量和多种气体，造成作物烧根、烧苗，并使土壤缺氧；
第三是鸡粪是酸性肥料（pH值为3.6～4.7），在果园里施用酸性鸡粪无异于“雪上加霜”；会让土壤加重酸化，造成根系受损，吸收不好，严重的会引起烂根。
第四是重金属超标，鸡粪中含有高含量的铜、汞、铬、镉、铅、砷等重金属，还有较多的抗生素和激素残留，会造成农产品重金属超标，给食品安全埋下隐患。
下面我简单说下比较安全可靠的有机肥，有机肥最重要的是原料问题：原料最好选用粮食下脚料，一些药厂的药渣。来源可靠，可以用微生物菌充分腐熟发酵，安全性高，作物可以完全吸收，有机质是多种复合酸组成，可以螯合土壤中的大量元素，使用这种有机肥，可以改变土壤微环境问题，选用中性有机肥，不会加剧土壤酸化，长期使用有改善土壤条件的作用，还能满足作物地上部生长的生理需求，并且能够持续改良土壤，生产出优质农产品。
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