初始经验治疗：常见病原菌有草绿色链球菌、肠球菌属、葡萄球菌属、念珠菌属、需氧革兰阴性杆菌等感染。
首选药物：首选苯唑西林，静脉滴注，一次1~2g每4小时一次，加庆大霉素，静脉滴注，一次80mg，每八小时一次。或首选青霉素静脉滴注，一次400万U，每六小时一次。或阿莫西林克拉维酸，静脉滴注，一次1.2g，每八小时一次。或氨苄西林，一次2~3g，每6小时一次。加阿米卡星，静脉滴注，一次0.4g，一日一次。疗程一般4~6周
次选药物：若有心脏修补术或者青霉素过敏，或者怀疑为耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌感染时，可用万古霉素，静脉滴注，15mg/Kg，每十二小时一次，加利福平，一次0.3g，口服，一日2~3次
说明：对于人工心脏瓣膜心内膜炎和真菌性心内膜炎，疗程需要6~8周或更长以降低复发率。应用庆大霉素和万古霉素时需监测血药浓度和药物对耳、肾的毒性。
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