庫頁島位於俄羅斯東部，日本北部，俄羅斯稱之為薩哈林島，日本稱之為樺太島。面積7.4萬平方公里，相當於兩個海南島。
西漢初年，中原王朝就已經對庫頁島有所瞭解。晉朝史書記載了庫頁島的位置，並知曉其為海中島嶼。唐朝時，東北黑龍江流域居住著靺鞨族，稱為黑水靺鞨，並歸順於唐朝。725年唐朝在此設立黑水軍，後改設黑水都督府，治所在伯力，管轄黑龍江中下游地區和庫頁島，是唐朝羈縻統治區。
1037年，遼朝設置五國部節度使，管轄範圍包括庫頁島。後來金朝繼承了遼朝，繼續對庫頁島行使管轄權。1264年大蒙古國出兵征討庫頁島，1285年元朝在黑龍江入海口的奴兒干城設置徵東元帥府，1291年元朝出兵萬餘人再次征討庫頁島，使得庫頁島上各部落都臣服納貢。
1411年，明朝在元朝徵東元帥府舊地開設奴兒干都司，並開通驛站，更有效地直接管轄了黑龍江下游和庫頁島等地區。後明朝名太監亦失哈為欽差大臣，多次出巡奴兒干都司。1413年在奴兒干城建造了永寧寺，並立永寧寺碑以示紀念，上刻“敕修永寧寺記”碑文。1433年亦失哈第十次出巡奴兒干，發現永寧寺被毀，於是重建了永寧寺，並再次立碑，上刻《重建永寧寺記》碑文。永寧寺碑是明朝管轄黑龍江中下游和庫頁島的物證。清末時曹廷傑發現了永寧寺碑，並將碑文拓下，使其得以流傳於世。1904年俄國拆毀永寧寺，並將兩塊石碑搬走，轉移到海參崴博物館。
清朝建立後，庫頁島內附，先劃寧古塔副都統管轄，後來又劃歸三姓副都統管轄。奴兒干城清朝稱之為廟街。1689年清政府和俄羅斯帝國簽訂了《尼布楚條約》，明確庫頁島是清朝領土，在法理上歸屬於清政府。庫頁島在實際上也處於清朝有效管轄之下。1858年開始，俄羅斯帝國強迫清政府簽訂了一系列不平等條約，逼迫清政府割讓包括庫頁島在內的大片領土給俄國。從此庫頁島在實際上和法理上都不再歸屬於中國。
1860年俄國佔領庫頁島南端，與日本勢力發生衝突。1862年日俄雙方談判瓜分庫頁島沒有成功。1875年俄國以千島群島和日本交換了庫頁島南部主權。庫頁島完全歸俄國統治。1904年日俄戰爭，俄國戰敗，日本佔領了整個庫頁島。後俄國被迫割讓北緯50度以南的庫頁島給日本，實行南北分治。
1945年日本戰敗，蘇聯佔領了整個庫頁島，並將島上的日本人遣返。1951年日本宣佈放棄庫頁島主權，蘇聯正式控制庫頁島全境，這就是庫頁島的歷史。
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