大学里，一般书记大，但是如果这个校长在行业内是权威、院士，或者他的个人性格很强势，担任校长时间很长，那么校长的实权会更大一些。
这个与地方上不同，一个省、一个市，毫无疑问就是书记大，再牛逼的省长也必须对书记客气点，但是在大学以及其他事业单位里面，书记的权威没有那么大。
一个大学内部的学院、系之类的二级部门，很多时候是院长、系主任兼任了书记一职，如果没有兼任的，那么是院长、系主任大。
二级部门层面，党委工作的重头—重大战略部署和人事安排—已经不占据最核心的位置了，重要的是贯彻上级党委的部署和安排。
二级学院，书记院长差别没那么大，因为学院书记少了最大的一个权力，人事任免权。
大学以前一般是校长负责制，专家教授办学，绝大多数大学校长是一把手，部分学校看谁资历深谁强势谁一把手。
现在中央明确是党委领导下的校长负责制，从规则层面确定学校党政联席会议最终决策者一般是党委书记了，当然根据具体学校的运作情况实际操作中也有特例。
以2017年人民网刊发的一篇《二级学院党委领导下的院长负责制探索与实践》举例，党委的领导职责主要是把好方向、抓好大事、出好思路、管好干部、研究决定重大事项。
而院长负责的职责是研究处理行政日常工作，提交党委会研究决定的有关教学、科研和其他行政工作等重大事项提出研究方案或主导意见，党委会作出决策后予以组织实施，并与党委共同抓好监督落实，不断完善决策、执行、监督体系和机制。
党委的各项决定，属于党务范畴的由校党委书记负责推进，属于行政范畴的由院长负责落实。
二级学院一般来说还是院长有拍板权的，因为首先文件没有明确二级学院也是总支书记领导院长。
实际操作中院长一般都是教学科研一线带头人，在二级学院学术、职称评聘、教学管理等实际操作中都是绝对的领导。
书记则一般是搞学生工作和政工出身，大部分书记不是教学科研一线上来的，就算规定书记是二级学院党政联席会议的负责人实际上也做不来。
书记只是不太管日常事务，但是到了重要决策性的一般是书记拍板。
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