一群理工男的风云际会:摩尔定律+香农定理+生命中心法则

点击上方蓝字关注“尹哥聊基因”

一群理工男的风云际会:摩尔定律+香农定理+生命中心法则

2018年10月26日,第三届基因组云计算技术开发者大会(GCTA2018)在深圳国家基因库召开。生物技术(BT)和信息技术(IT)的融合,云计算的风起云涌,将我们带入了一个解读生命密码、认识疾病本源、重新定义健康的新纪元。

第三届GCTA由华大基因和亚马逊AWS主办,秉承“共享、共为”的精神,涵盖三大主题:Big Data for Life(生命大数据)、Cloud Computing for Omics(生物信息云计算)、Artificial Intelligence & Bio-Intelligence(人工智能与生物智能)。

本文为您分享我在本次大会上的致辞内容。

会议照片精选

一群理工男的风云际会:摩尔定律+香农定理+生命中心法则
一群理工男的风云际会:摩尔定律+香农定理+生命中心法则一群理工男的风云际会:摩尔定律+香农定理+生命中心法则
一群理工男的风云际会:摩尔定律+香农定理+生命中心法则

<< 滑动查看下一张图片 >>

登山则情满于山,观海则意溢于海,吾辈才情之所向,虽风云并驱尔。

不知不觉,这已经是第三届风云际会了,我们相聚在这登山眺远、凭海临风的国家基因库以共襄盛会。

“不谋万世者、不足谋一时。”正如20年前,没有人会想到智能设备的普及会如此彻底,我也想快速回顾下基因组发展的这点事。

1989年,当人类基因组计划的发起者提出要测序完成一个人的全部基因时,他们被嘲笑,甚至有诺奖获得者讽刺说,这可能需要上百年才能做完。

2000年6月26日,当时任美国总统克林顿和英国首相布莱尔联合宣布HGP草图完成之时,我们算了下账,第一个人的基因组,由6个国家,十几个中心,8000余名人员,历经13年花费38亿美金才得以完成。这第一个人的基因组,区区3G的数据,也理所应当地成为了当时的基因大数据。

2008年,当华大基因在深圳完成了第一个中国人的基因组的时候,因为NGS技术的普及,成本由38亿美金下降到数千万人民币,这个3G的数据成为了首个中国人、乃至东亚人的基因大数据。

当我们开始比较黄、白种人的基因组之时,我们发现了无论是SNP还是结构变异都具备一定种群特异性,需要更多的群体参与到其中的研究,于是我们联合英美发起了千人基因组。

千人基因组启动于2008年,2015年当2504个人的基因组序列公布之时,我们开始知道了更多的人类族群密码,也发现了全人类基因竟然有超过99.5%的一致性,从那时候起,群体遗传学的发展一日千里,基因大数据的应用日新月异。

2015年,Illumina率先在全球将WGS的成本降到了1000美金之内。

2018年,BGI(华大基因)率先将WGS成本降到了仅600美金。并和阿里云、Intel等合作伙伴一起承诺,在2020年底前,将WGS成本降到300美金,从收到样本到交付数据的时间可以在24小时之内完成。

今年的10月3日,英国在继Genome England之后,发起了500万人的全基因组测序计划,同时也在全球率先将WGS检测纳入NHS,即列入医保。

今天屋内的诸位,我相信没有人会质疑人人基因组时代即将到来,只是说这个时间点是3、5年还是10年20年的问题,但我们终将看到,未来,已来。

工业革命以来的发展,呈现出科学发现、技术发明、产业发展的三发联动的循环迭代。而过去异想天开,今天勉为其难,未来习以为常的我们称之为“颠覆性技术”。

当我们不满足于仅知情于基因组DNA之时,我们便开始用液体活检来监测体内的各种时空变化。

当我们不满足于仅知情于基因组层面时,我们开始把包括基因组、转录组、代谢组、生理生化组、肠道菌群、影像组、环境组,甚至社会群体和个体心理层面来联合起来分析问题,即跨组学研究。

当我们不满意冯诺伊曼架构的运算效率时,我们开始期待更强大的量子计算和生物学计算。

当我们不满意无机硅和无机碳的存储效率时,我们开始和最好的老师,即大自然学习,用DNA来进行信息存储。

当我们不满意4G的传输效率时,我们开始期待光纤中继、5G技术的普及。

我、华大人和今天屋内的诸位一样,我们在挑战摩尔定律、在挑战香农定理,在完善中心法则,在尝试用自然科学的最高等语言,即数学来描述生命,完成IT和BT的衔接,不断靠近生物智能。

工业时代的产出是产品,统一在原子上,是你的就不是我的,分享了就会因为折旧而贬值;IT时代的产出是信息,统一在比特上,是你的也可以是我的,越分享越增值;而BT时代的产出是生命,统一在DNA上,原本就是我们一起的,我们永远都不要忘记HGP所定义的原则:共有、共为、共享。

一个人可以走得很快,一群人才能走得更远。今天参会的各位,请大家都拿出您和贵司的真知灼见,让我们共享思想,沉浸在基因大数据的思维盛宴吧。

——尹烨《在第三届风云际会上的致辞》


分享到:


相關文章: