长期以来，白芨组培苗种植存活率低下，一直是家种生产的最大“陷阱”，往往造成农户或投资者“血本无归”。
白芨的种苗通常要经过引进种源、组培、炼苗和根须发达后，再进行移栽。但由于白芨根茎的生长需要共生菌的环境，且移栽和管理非常精细，死苗率通常可达50%甚至更高。白芨喜阴、喜潮、不耐涝、不耐旱、喜有机质高的偏酸性土壤。
种植白芨选好土壤很重要，要选择肥沃而且排水较好的土壤，比如沙质土，黄沙土是白芨最适合的土壤，土壤中要含有丰富的腐殖质，这样透气性良好且保水性能强。可以使用益富源植物营养液发酵腐殖质，培制营养土，育苗过程定期用500倍催芽生根剂喷洒土壤补充益生菌，保持土壤通透湿润，且生态环境丰富稳定。
白芨不适合过高海拔，一般控制在2600米以下为宜；如山地栽种时，宜选阴坡生荒地栽植。白芨喜阴湿的环境，需要经常浇水保湿，但是也怕涝，如果雨季排水不畅，会导致块茎腐烂。白芨多生长在长江以南地区，气候温度适宜，但是南方多雨水，遇到雨季，很容易发生烂根现象。要在春夏雨水较多的季节，注意做好排水防涝工作。可以事先挖排水沟，保证排水通畅。
种植白芨的温度不能太低，同时要注意避免暴晒强光，保持一定的湿度。第一年移栽需搭建遮阴棚，否则死苗率高。白芨虽然喜欢温暖阴湿环境，但是不耐寒，注意冬冷季节防寒，冬天倒苗后应盖草防寒。
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