神舟飞船是我国的太空载人往返运载系统，自从杨利伟上天以来的多次执行任务，它保持着百分百的安全性，可以说是一件“信得过产品”，但不为人知的是，在他的实验过程中，也有过多次意想不到的事件发生。
比如在杨利伟第一次参加载人航天实验的时候，乘坐长征2f火箭搭载的神舟5号飞船进入太空，就曾经遇到火箭的共振，时间长达26秒，五脏六腑如翻江倒海，那是一种让人非常难受的情况，一度让杨利伟“感觉要牺牲了”，而且在返回的时候，神舟5号重新进入浓厚的大气层，巨大的降落伞拉开的时候还破了一点，然后就是在返回舱落地的时候，速度有点儿太快，导致飞船返回舱落地后又弹起，使得杨利伟在飞船中也经受了猛烈的震荡，而且由于嘴角磕到了麦克风上，把嘴角竟然都磕破了，不过幸好都没有出大问题，作为中国第一首载人飞船，神舟5号也算圆满完成了任务，就像杨利伟对媒体记者所说的那样，即便是普通人乘坐神舟5号飞上天，活着回来也是没问题的。
但是在杨利伟乘坐神舟5号飞天之前，中国的神舟飞船已经试验了四次，其中第二次尤其危险，即神舟2号上天的时候，杨利伟曾在采访中透露：在“神舟二号”上天后返回时，降落伞竟然没有打开，返回舱来了个硬着陆，如果人在里面的话，巨大的冲击力会让人遭遇生命不能承受之重，从而难以保住生命，杨利伟关于神舟2号的表态也是我国航天首次公开承认“神舟二号”返回时出现重大故障。
其实关于神舟2号返回的情况，很多人曾经产生过疑问，因为据说当时“神舟二号”发射的时候，各方面的关注和报道很多，但是在返回后却基本没怎么报道，而且在其他几艘神舟飞船返回的时候都用了“成功着陆”这个词，但只有神舟二号用了“成功返回”，虽然同样是成功，但是情况却是不一样的，或者说结果也是完全不同的。
虽然很少有讲到神舟2号返回时情况的报道，但是在《载人航天发射技术》一书中，也用了很明白的表述，就是“在飞船返回过程中伞系统发生故障”。还有就是，“神舟二号”升空时携带有不少信封邮件，但是不少都烧毁了，由中国航天医学工程研究所制作的一枚保存了下来，信封上贴长城普票200分和80分票各一枚，但是该信封右侧上端边缘有烧焦痕迹，这可能是因为神舟飞船在返回大气层中的速度过大，与大气层发生剧烈摩擦，温度上升，某些保温层被破坏，烧焦了里面的一些信件等等，这样的情况都发生了，飞船里面的景象可想而知，如果有人的话，可能到不了地面就热死了，即使没热死，落地时巨大的冲击力也不是人所能承受的。
为什么会发生这样重大的系统故障呢？有网友认为，这是由于当时飞船上主副伞切换装置还没搞定，神舟二号都是只装了主伞，由于没有副伞引导，导致主伞没能打开，才出现了上述情况，但是也正是由于出了这样的事故，飞船返回舱的降落伞安装和控制系统都进行了彻底的改进，于是之后的神舟飞船发射返回都没有出现过这样的事故了。
