弗朗西斯科·皮萨罗被刺杀后，引发了一系列连锁反应。国王的代表巴卡·卡斯特罗下令镇压叛乱，超过两百的阿尔马格罗派在内战中丧生，所有参与了叛乱的阿尔马格罗派的人都被处以绞刑。不过，有一个叫迭戈·门德斯的阿尔马格罗派带着六个人逃了出来，投靠了曼可·印加在比尔卡班巴的小王国。
曼可对西班牙人的内战非常高兴，本来他想把这七个西班牙人处死，但是想到他们刺杀了弗朗西斯科·皮萨罗，他还是收留了他们。于是，他忘了自己亲自经历的一个深刻教训：永远不要相信西班牙人。曼可给这些西班牙人修建了房屋，提供食物和酒水，还同他们一起吃饭，把他们当做自己的兄弟一样。作为回报，西班牙人给曼可讲解先进的欧洲武器，还讲述了欧洲文明社会的政治和生活的情况。
安第斯山的土著妇女
不过，这些西班牙人并不想在这儿久留，他们无时无刻不想回归文明社会。他们的机会终于出现了。查理五世派来了新的总督堂布拉斯科·贝拉，来管理这个国家。门德斯一直盼着这一天，这也是他们刺杀皮萨罗的最终目的所在。不过，他们想要获得新总督的信任是很困难的，他们的身份是叛贼，按照西班牙的法律，他们一定会被绞死。除非，他们能将功折罪，而且，不是一般的功劳，须是一件大功。如果他们杀死了曼可·印加，他们或许能得到总督的赦免。
主意已定，七个西班牙人准备利用曼可的信任，在曼可和他们玩套圈游戏时刺杀他。曼可毫无防备，门德斯在玩游戏时掏出一把尖刀，刺穿了曼可的身体。然后，他们向库斯科方向逃跑。不过，他们在森林里迷了路，筋疲力尽时在一间草房子里休息。安蒂人和印加人追上了他们，包围了草房子，并放火点燃了房子。七个西班牙人有的被烧死，有的被棍棒打死，无一幸存。
皮萨罗兄弟中，有两个已经去世，有一个在西班牙的监狱中。只有贡萨洛·皮萨罗还在印加。他现在非常富有，本来可以过一种平静的生活。他现在已经32岁，但仍然冲动，鲁莽。他认为印加的天下是他们兄弟出生入死打下来的，新来的总督没多少功劳，也没有打过多少仗，而自己竟然还要接受他的管辖，这是天下最荒唐的事。他宣布自立为总督，这个决定显然太愚蠢了，这可是叛国罪。然而，如今没有任何兄长来制止他的胡闹了。他挑战西班牙帝国的法律，不承认国王任命的总督。一场内战再次发生，贡萨洛杀死一切反对他的人，甚至保持中立的人，他杀死了三百四十名西班牙同胞。这个数字比印加人历年的抵抗战争所杀死的所有西班牙人还要多。
贡萨洛的政变一开始取得了一些进展，他抓住了国王派来的总督贝拉并将其砍头示众。他的军队连战连胜，一度发展到1500多人。从军事的角度来说，贡萨洛干得不错。他的确是一个军事天才，自来到印加以后从来没有打过败仗，这也是他敢于造反的底气。不过，他离最后的胜利还是很遥远，国王很快又派来一位新的总督佩德罗·加斯卡，统领平叛的队伍。即使贡萨洛每一场战斗都获得胜利，他还是无法战胜对手，相反，他的军队在迅速减少。因为新来的总督宣布了国王的一项命令，倒戈脱离叛军的人将获得国王的特赦。这样，贡萨洛的军队纷纷投向国王一边。在经历了三年半的战争后，他终于清楚，他没办法和整个帝国抗衡。他放下了武器，愿意接受国王的处罚。
贡萨洛·皮萨罗被叛处斩首。在皮萨罗兄弟来到印加16年后，留在印加的最后一个皮萨罗也死了。贡萨洛被宣布为叛国者，他的财产被没收，他在库斯科的房子被拆毁，他的首级被挂在“国王之城”利马当街示众。
弗朗西斯科·皮萨罗
