近年來，在嫁接黃瓜生產中根腐病發生較重，影響了黃瓜的產量和效益。嫁接黃瓜根腐病多發生在利用黑籽南瓜嫁接的黃瓜生產田中，在黃瓜開始採收前生長正常，黃瓜開始採收後開始發病。
用作砧木的黑籽南瓜莖基部發生水浸狀變褐腐爛。發病輕的外部症狀不明顯，砧木和接穗的維管束不變褐，但毛細根變褐腐爛，主根和支根一部分變為淺褐色至褐色，嚴重的根部全部變為褐色至深褐色，後毛細根基部發生縱裂。且在不整齊的縱裂中間產生灰白色的黑帶狀菌絲塊，在根部細胞上可見密生的小黑點，是病原菌分生孢子器。接穗黃瓜發病進程緩慢，初期葉片失去活力，中午前後發生萎蔫，早晚或陰天尚可恢復。持續數日後，下部葉片枯黃，並逐漸向上擴展，側枝和瓜條的發育受到抑制，致使全株死亡。
嫁接黃瓜根腐病由擬莖點黴真菌侵染所致。病菌發育適溫24℃-28℃，最高32℃，最低8℃。病菌隨病殘體在土壤中越冬，翌年定植嫁接黃瓜易發病，地溫15℃-30℃均可發病，20℃-25℃發病重。
嫁接黃瓜根腐病的防治方法
1.搞好苗床消毒。在高溫季節晴天密閉棚室，育苗床或育苗溫室土壤覆蓋塑料膜，利用太陽能高溫悶殺進行土壤消毒，使床土在50℃左右的條件下處理10分鐘，可殺滅土壤中大部分致病病菌，大大降低發病率；對發病重的地塊或苗床可用多菌靈、敵克松或甲基託布津等，藥和土按1∶10的比例配成藥土，播種或定植前用藥土進行土壤消毒處理，也可用土菌消、惡黴靈等藥物進行床土處理。
2.加強管理，提高抗性。定植前測土配方施肥，增施有機肥。定植後，前期適當控制澆水，以提高地溫，促進根系發育。結瓜後適當增加澆水次數並及時追肥，防止脫肥造成植株早衰。注意通風降溼。
3.選用抗病砧木品種。
4.用藥防治。發病初期用50%苯菌靈可溼性粉劑1500倍液、10%苯醚甲環唑水分散粒劑1500倍液灌根，每棵灌藥液250毫升。
