多年來，抗菌療法一直是治療痤瘡特別是中重度痤瘡的有效方法之一。痤瘡抗菌療法包括系統抗生素治療、外用抗菌製劑以及非藥物治療等。
系統應用抗生素治療痤瘡主要依靠其抗菌作用和非特異性抗炎作用2個方面起作用，抗生素有效到達毛囊、皮脂腺部位是保證抗菌效應的條件。可供選擇的藥物有四環素類、大環內酯類、克林黴素、復發新諾明和喹諾酮類。米諾環素、多西環素以及賴甲環素其抗菌活性高，耐藥性低，併兼有明確的非特異性抗炎作用，因此在國際治療痤瘡共識中推薦為首選。
為減少抗生素耐藥的產生，提高治療效果，應嚴格把握適應證，按病情需要用藥，不推薦單獨使用抗生素治療痤瘡，治療開始時劑量要足，但過高的劑量並非可以獲得更好的效果；一旦有效後不宜減量維持，要保證足夠的療程，通常連續使用6周以上，但不宜超過12周，並避免間斷使用；如治療2 ~ 3周無效，應及時停用或更換抗生素。
通常米諾環素和多西環素的劑量為每日100 ~200 mg，可1次或分2次口服；四環素每日1.0 g，分2次空腹口服；紅黴素每日1.0 g，分2次口服；紅黴素僅在妊娠、14歲以下兒童使用；其他如頭孢菌素類藥物、新型大環內酯類以及氟喹諾酮類等藥物，不宜作為痤瘡抗菌治療的常規選擇藥物。
痤瘡丙酸桿菌是正常皮膚的寄生菌，治療以有效抑制繁殖為目的，而不是完全消滅，因此不可無原則地加大劑量或延長療程，更不可以作為維持治療甚至預防復發的措施。療程中不隨意更換抗生素，一般原治療有效的病例復發後應堅持使用同種藥物治療。
如使用其他治療方法可以產生同樣的效果時，不推薦使用抗生素；也不推薦單獨外用抗生素治療痤瘡，尤其是長期或反覆外用抗生素。也不主張外用和口服同種類抗生素，這樣不僅不能提高抗菌治療的效果，反而容易誘導耐藥性特別是多重耐藥性的產生。
過氧苯甲酰製劑、壬二酸、外用維甲酸製劑，可作為抗菌治療的基本聯合方法，還可作為維持治療手段，可減少因停用系統抗菌藥物後痤瘡丙酸桿菌再繁殖，減少復發。口服鋅製劑也有抑制痤瘡丙酸桿菌脂酶活性的作用，可作為系統治療的補充。光療，特別是近年開展的光動力治療、紅藍光治療，可以協同提高抗菌效果，而且對敏感或耐藥的痤瘡丙酸桿菌均有效果，對減少耐藥菌的產生和減少抗生素的使用均有積極的意義。
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