- 中国科学院沈阳分院是中国科学院的派出机构,负责联络和协调中国科学院在辽宁省和山东省的研究所。
- 沈阳分院系统现有7个法人研究所：在辽宁省的大连化学物理研究所、金属研究所、沈阳应用生态研究所、沈阳自动化研究所，在山东省的海洋研究所、青岛生物能源与过程研究所、烟台海岸带研究所。
1.中国科学院海洋研究所
- 中国科学院海洋研究所始建于1950年8月1日，是新中国第一个专门从事海洋科学研究的国立机构，是我国海洋科学的发源地，目前是我国规模最大、综合实力最强的综合海洋研究机构之一。
- 研究所拥有实验海洋生物学、海洋生态与环境科学、海洋环流与波动、海洋地质与环境、海洋环境腐蚀与生物污损5个中科院重点实验室以及海洋生物分类与系统演化实验室、深海研究中心。
- 海洋所现有在职职工700余人，其中专业技术人员近500人；中科院院士2人、工程院院士1人，博士生导师近100人，硕士生导师140余人。作为中国科学院博士研究生重点培养基地，设有海洋科学、环境科学与工程、水产3个一级博士点、9个二级博士点和10个硕士点，以及海洋科学博士后流动站。
2.中国科学院青岛生物能源与过程研究所
- 中国科学院青岛生物能源与过程研究所是由中国科学院、山东省人民政府、青岛市人民政府于2006年7月启动筹建，2009年11月30日通过共建三方验收并纳入中国科学院“知识创新工程”管理序列的国立科研机构。
- 青岛能源所目前建有中科院生物燃料重点实验室、中科院生物基材料重点实验室、山东省合成生物技术创新中心等16个省部级平台。
- 截止2019年底，青岛能源所拥有生物学、化学工程与技术两个博士后流动站，生物学、材料科学与工程、化学工程与技术三个一级学科博士培养点；生物工程、材料工程、化学工程等三个专业硕士学位培养点，形成了涵盖生物、化学、化工、材料等领域的学科培养体系。
3.中国科学院烟台海岸带研究所
- 中国科学院烟台海岸带研究所筹建于2006年，正式成立于2009年12月1日，由中国科学院与山东省、烟台市三方共建，是专门从事海岸带综合研究的唯一国立研究机构，位于美丽的海滨城市—山东省烟台市。
- 中国科学院烟台海岸带研究所以“认知海岸带规律，支持可持续发展”为使命，面向国民经济主战场，围绕生态与环境领域和海洋领域，按照“陆海统筹、科学与技术统筹、科技与社会发展统筹”的发展思路，聚焦海岸带生态环境安全、资源保育利用与可持续发展管理三大特色领域，构建海岸带综合观测与实验平台和海岸带综合数据中心等综合支撑系统。
- 学科培养点，有环境科学、环境工程、海洋化学、海洋生物学四个二级博士学科培养点，有环境工程和生物工程两个专业硕士培养点，形成了较为完整的研究生培养体系。
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