伤寒，有广义伤寒和狭义伤寒两个概念。
广义伤寒是指人体感受风寒暑湿燥火等自然界六淫之邪，感而即发的疾病。
狭义伤寒是指人体感受寒邪感而即发的疾病。
伤寒为病，病邪从肌肤而入，由表传里，所以初起在治疗上宜辛温发散，
寒疫，《伤寒例》云：从春分以后，至秋分节前，天有暴寒者，皆为时行寒疫也。又云：凡时行者，春时应暖，而复大寒；夏时应大热，而复大凉；秋时应凉，而反大热；冬时应寒，而反大温；此为非其时而有其气，是以一岁之中，长幼之病多相似者，此则进行之气也。阴阳大论云：春气温和，夏气暑热，秋气清凉，冬气冷冽，此四时正气之序也。
也就是说，春温，夏热，秋凉，冬寒，是正常的气候变化。如果出现了反常气候，就会发生时行之病，而发生在春分至秋分之间，天气突然反常暴寒，就叫时行寒疫。新冠肺炎发生在冬至，小寒，大寒期间，所以新冠肺炎不属于时行寒疫。中国工程院院士仝小林是首先把新冠肺炎定位于寒湿疫的，但是中国中医科学院进驻一线临床后，制定了详尽的瘟疫辩治方案。
温病，即感受温热邪气引起的外感热病的总称。《伤寒例》云：其伤于四时之气，皆能为病。以伤寒为毒者，以其最成杀厉之气也。中而即病者，名曰伤寒；不即病者，寒毒藏于肌肤，至春变为温病，至夏变为暑病。这一段后面部分讲的温病就是后世温病学家所说的“伏气温病”。也即《内经》所说的“冬伤于寒，春必病温”。还有一种温病，即感受温热邪气，感而即发的温病，也就是新感温病。新感温病的感邪途径，即叶天士《温热论》所云：温邪上受，首先犯肺，逆传心包。《伤寒论》第六条云：发热而渴，不恶寒者为温病。明确区别于伤寒的发热不渴，和恶寒。并严格指出温病治疗禁用发汗，泻下，和热熨，艾灸，火针等温热疗法，这充分说明，张仲景用伤寒法治疗温病失败了，同时也没有找到治疗温病的明确方案。在现在，由于部分中医认识上错误，仍然在重复着两千年前张仲景的错误，但这不能说伤寒方剂就不能用于温病治疗了，其中白虎汤，承气汤，麻杏石甘汤，葛根汤，黄芩汤，竹叶石膏汤等仍然是后世治疗温病的有效方剂。后世温病学家对于温病不夹湿热者，按卫气营血辩治，各阶段代表方剂为卫分证用银翘散，气分证用白虎汤，营分证用清营汤，血分证用犀角地黄汤。新感温病和伏气温病的不同是，新感温病初起为卫分证，宜辛凉透表兼清表热；伏气温病初起即见气分证或营分证，宜直清里热。
瘟疫，是有疠气所致的，广泛流行的烈性传染病，明末医家吴又可著《温疫论》，明确瘟疫的病因“非风非寒非暑非湿，乃天地间别有一种异气所感”，异气即疠气，或疫气，戾气，吴又可把这种异气直接定位于“瘟疫毒邪”。以此区别于风寒暑湿燥火六淫之气。感邪途径为口鼻且表里分传，邪伏膜原。制定了方剂达原饮，以草果，槟榔，厚朴辛行化湿辟秽，开达膜原，以黄芩，知母清解里热。新冠肺炎就是属于瘟疫，所以治疗上应该借鉴瘟疫的辩证治疗。
从以上可看出，伤寒，温病，瘟疫的脉络走向很清楚。
《难经。五十八难》云：上含有五，有伤寒，有中风，有湿温，有热病，有温病。由此可以看出广义伤寒，包括了伤寒和温病，瘟疫的病因是疠气，而疠气不在六淫之内，所以从病因学上分析，瘟疫不在广义伤寒范围，但是疠气著人，化为热毒，仍是热邪，所以温病学家仍然把瘟疫归类为温病范围。所以，现在的这几个概念的范围归类是这样的，广义伤寒包括狭义伤寒，和温病，温病包括瘟疫。
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