1945年8月，日本军方和日本政府意识到战败时日将近，为了掩盖战争罪行，掩盖细菌部队违反国际法、违反道德的行为，密电石井四郎销毁证据，炸毁各支队建筑物和研究设备，使用毒气等方式杀害“马路大”，放逐实验用的老鼠、跳蚤等动物。有关利用人体实验获得的珍贵资料和数据等没有毁掉，偷偷运回了日本国内。图为被炸毁的焚尸炉残迹。
1945年8月，日方开始下令炸毁第七三一部队等细菌基地的建筑设施，销毁实验用具；杀害马路大，焚尸灭迹，将焚烧过的尸骨丢入松花江。大量感染鼠疫的老鼠被放逐，导致鼠 疫泛滥，多名无辜村民感染鼠疫，罹难身亡。图为日本投降前，七三一部队破坏细菌设备现场。
日军平房细菌战基地被破坏后，大量感染鼠疫的老鼠逃出，平房细菌战基地周边村庄突然出现大量的老鼠，其中还有在中国东北从未见过的白老鼠。从1946年6月到9月间，七三一部队周围的后二道沟、义发源、大东井子一带鼠疫泛滥，死亡者计121人。直到1959年，鼠疫仍然断断续续地发生，期间又出现多名罹难者。图为被破坏的七三一细菌部队动力班遗迹。
图为七三一部队细菌试验中心残迹。
图为七三一部队被炸毁的发电机。
从1945年8月10日开始，日军平房细菌战基地人员陆续撤退，除骨干成员搭乘飞机撤走外，其他1700余名细菌战基地的队员、军属、家属等搭乘军部专门调配的列车开始了大撤退。8月14日，最后一批人员撤走。这一天，在列车临出发前，石井四郎对所有人员大声命令“走到哪里也要严守七三一部队的秘密，如果谁泄露了军事秘密，我石井，就追你们到那里！”图为七三一部队逃跑线路示意图
为了封住每一名在细菌战基地工作过的人员的嘴，石井四郎特意向每名队员发放了“封口慰劳金”。七三一部队成员撤回日本后，在部队解散当日，石井四郎再次下达命令：“部队的秘密要带到坟墓！战后不得充任公职！队员之间不得互相联系！”图为七三一部队逃回日本后在金泽市野间神社聚集。
逃回日本的石井四郎隐居在东京新宿区若松庄。
以上图文选自《日本侵华图志》第十五卷《化学战与细菌战》， 高晓燕、王希亮编著，山东画报出版社2015年5月出版。《日本侵华图志》共二十五卷，南京大学资深荣誉教授张宪文主编。教育部人文社科重点研究基地、南京大学中华民国史研究中心、山东画报出版社有限公司合作项目，并入选“十二五”国家重点图书出版规划项目，国家新闻出版改革发展项目库 2014 年度入库项目。
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