研制疫苗关键一步!美国创建首个新冠病毒3D原子图

2 月19 日,国际顶尖学术期刊《Science》刊发了美国德克萨斯大学奥斯汀分校Jason S McLellan 团队的一篇重磅成果。


研究人员通过冷冻电镜Cryo-EM 技术,解析出新冠病毒S 蛋白三聚体3.5 埃的近原子分辨率结构,迈出了疫苗研制关键一步。


值得一提的是,这篇论文首次提出新冠病毒S蛋白结合ACE2的亲和力要远高于SARS-CoV的S蛋白,是SARS的10到20倍,这可能意味着新冠病毒肺炎(COVID-19)比SARS的传染性要强很多。


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病毒要进入人体细胞,必须找到人体细胞上相应的受体蛋白,如果将每个受体比作一把“锁”的话,S蛋白便是新冠病毒打开这把“锁”,后进入细胞内部的“钥匙”。


在从中国研究人员那里获得该病毒的基因组序列后仅两周时间,研究小组就设计并生产了其稳定的刺突蛋白样品,大约花了12天的时间来重建刺突蛋白的3-D原子尺度图(即分子结构)。


该模型还可帮助科学家开发新蛋白,结合到刺突的不同部位,阻止其发挥功能,治疗已经被感染的人。


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2019-nCoV S蛋白结构


这是科学家首次通过冷冻电镜对新冠病毒S 蛋白结构进行详细观察和解析,从生物物理及结构生物学的角度加深了对新冠病毒的认知,为疫苗研发等相关工作奠定了夯实的基础。研究小组正在将其分子结构图发送给世界各地的研究者,包括中国的许多团体,这将有助于疫苗的研发。


研究小组获得结构的分子仅代表刺突蛋白的细胞外部分,但足以在人体内引发免疫反应,因此可以用作疫苗。


接下来,McLellan的小组计划使用他们的分子对引起COVID-19的病毒进行另一道攻击,利用该分子作为“探针”,从感染了新型冠状病毒并成功康复的患者中分离出天然产生的抗体,暴露量足够大后,这些抗体可以帮助治疗冠状病毒感染。


领导该研究的教授詹森·麦克莱伦(Jason McLellan)和他的同事们花了很多年研究其他冠状病毒,包括SARA冠状病毒(SARS-CoV)和MERS冠状病毒(MERS-CoV),这种经验使他们比其他研究新病毒的研究小组更具优势。


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Jason S. McLellan(左);论文共同第一作者、博士生Daniel Wrapp(中)和研究助理王年爽(右)


此外,这次研究破解工作使用了斩获2017年诺贝尔化学奖的“冷冻电镜”,这也是该研究获得成功的关键。


冷冻电子显微镜(cryogenic electron microscopy,简称cryo-EM),即应用冷冻固定术,在低温下使用透射电子显微镜观察样品的显微技术,让研究者能将生物分子“冻起来”,前所未有地观察分析运动过程。


新冠病毒为什么传染性更强


早在 1月下旬,中国科学院武汉病毒所石正丽团队在 Nature 发表的研究论文中,便证实了新型冠状病毒感染人体细胞的关键就在于 S 蛋白与 ACE2 蛋白的结合


在此次解析S 蛋白结构的工作中,通过与SARS病毒的结构比较,Jason McLellan研究小组认为,新冠病毒的S蛋白结合人体ACE2(宿主细胞受体血管紧张素转化酶2)的亲和力要远高于严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)的S蛋白。


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通过计算,SARS病毒S蛋白与ACE2的平衡解离常数KD是325.8 nM,新冠病毒S蛋白与ACE2的平衡解离常数KD是15 nM。(上图A)


KD值越小意味解离越多,S蛋白与ACE2的亲和力越强,这意味着新冠病毒S蛋白与ACE2的亲和力,是SARS病毒S蛋白与ACE2之间亲和力10倍,甚至20倍,这解释了为什么新冠病毒传染性要比SARS病毒强得多,当然,还需要进一步研究确认这个结论。


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新型冠状病毒病毒对于ACE2具有高亲和性

  

参考链接:


https://science.sciencemag.org/content/early/2020/02/18/science.abb2507


https://news.utexas.edu/2020/02/19/breakthrough-in-coronavirus-research-results-in-new-map-to-support-vaccine-design/

https://medicalxpress.com/news/2020-02-breakthrough-coronavirus-results-vaccine.html


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