為了遏制新型冠狀病毒肺炎疫情在美擴散，往返於美中兩國的各大航空公司也響應川普政府的旅行行政令採取了停飛措施。
美聯航
美聯航2月5日回覆記者表示，從2月3日到3月25 日暫停與中國北京、上海和成都的直飛航班。目前無法確定是否會在3月26日恢復航班。
美國航空
美國航空在官網發佈公告稱，基於美國國務院將最近到中國的旅行警告升至第四級，為不要到中國旅行。美國航空公司於1月31日到3月27日暫停所有美中兩國航班，並將會評估3月28日是否恢復航班。
達美航空
達美航空宣佈取消2月6日到4月30日的美中直飛航班，達美在中國每週運行42趟航班，包括北京-底特律，北京-西雅圖，上海-亞特蘭大，上海-底特律，上海-洛杉磯，上海-西雅圖之間的每日直飛航班。2月6日前購買了機票的乘客，機票可免費改簽一次。
中國東方航空
根據東方航空發佈的公告稱，該航空公司將會執行川普政府的旅行行政令，禁止過去14天在中國的旅客進入美國，美國公民除外，凡在1月24日到6月30日之間購買了東航與美國直飛機票的乘客，可免費改簽一次，改簽至2020年6月30日之前。
海南航空
海南航空於2月1日到3月31日間，暫停北美、歐洲、東南亞、日本和中國臺灣部分航班，併為乘客提供免費改簽服務。
中國國際航空
根據人民網消息，因新型冠狀病毒疫情，中國國航2月2日向美國交通部提交緊急申請，欲調整中美定期航班服務，並於3日得到批准。
中國國航將從2月11日到3月28日之間，中國國航將執行一週7趟航班飛往美國，分別是一週4趟從北京飛往洛杉磯和舊金山，班期為每週二、四、五、日，以及
一週3趟從北京飛往紐約和華盛頓，班期為每週一、三、六。航班機型為波音777-300ER。 紐約彩虹國際旅行社說，目前紐約、華盛頓、舊金山、洛杉磯、芝加哥這五大城市的機場沒有暫停美中航班。
目前只有中國國際航空和東方航空的美中直飛航班沒有完全取消，但機票票價都有所上漲，比如國航票價每張單程超過6千美元，東方航空機票價格單程上漲至快8千元美元，而每年2月並不是旅遊旺季，一般直飛機票在500美元就可以買到。
目前從中國直飛美國的航班只有國航和東航，直飛香港的國泰航空目前票價相較於往年同期漲幅並不大，單程在1200美元到1300美元，原因是中國大陸航班已無法到達香港，只有香港當地人可以飛往美國。
各大航空公司暫沒有說明什麼時候會恢復美中航班，目前，東航4月底的大部分美中航班已取消。
對於想要改簽乘客，航空公司可免費改簽一次；如果需要退票的話，航空公司會根據乘客行程使用情況結算退款金額。
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