1996/97賽季的上半段，阿森納迎來了俱樂部歷史上第一位外籍主教練——阿爾塞納•溫格從日本的名古屋鯨八轉投而來。
1997/98賽季，也就是溫格成為主教練後的第一個完整賽季，他率領阿森納拿到了英超和足總盃的雙料冠軍，重演了1970/71賽季的神奇，這也是俱樂部歷史上的第二次。
2001/02賽季，阿森納在連續三年亞軍後，再次向曼聯發起了反擊。在這個賽季裡，溫格率領球隊再奪雙冠王。2002年5月8日，阿森納在老特拉福德球場1比0擊敗曼聯，提前鎖定該賽季的英超冠軍 ，在曼聯王朝的全盛時期，阿森納是唯一一支能夠和紅魔抗衡的力量。
2003/04賽季，是值得阿森納為之驕傲的一個賽季，他們奪取了俱樂部歷史上的第13座聯賽冠軍獎盃，整個賽季裡，阿森納高歌猛進，在英超中保持不敗，創造了令人吃驚的神話。2003/04賽季結束後，阿森納以90分領先第二名切爾西達11分之多。2004年8月，阿森納打破了諾丁漢森林保持的紀錄，締造英格蘭頂級聯賽連續49場聯賽不敗的新神話。
2006年7月，阿森納俱樂部告別了載滿榮譽的海布里球場，搬入了現代化的酋長球場。新球場為球隊和球迷帶來了更好的資源和服務，卻也使俱樂部背上了鉅額債務。球隊雖然每年都能夠爭取到歐冠席位，卻始終無法再舉起一座獎盃。2007年和2011年，阿森納兩次進入了聯賽盃的決賽，但均以1比2不敵對手。
2013/14賽季，阿森納3比2絕殺赫爾城，奪得足總盃冠軍，同時結束球隊八年無冠的尷尬境地。2015年5月31日足總盃決賽阿森納4比0戰勝阿斯頓維拉成功衛冕，阿森納也超越曼聯創紀錄第12次奪冠。2017年5月28日，阿森納在足總盃決賽中2比1擊敗切爾西奪得冠軍，這是阿森納歷史上的第13座足總盃，槍手超越曼聯，成為奪冠次數最多的球隊。這也是溫格舉起的第7座足總盃，他成為歷史上奪冠次數最多的教練。
2005/06賽季裡，年輕人的崛起讓阿森納看到了新的希望，球隊中的塞斯克•法佈雷加斯等一批新銳迅速成長，隨隊一路打進了歐冠決賽，雖然1比2負於西班牙的巴塞羅那，但這成為是槍手阿森納最接近歐洲之巔的一次。建設球場的高額話費讓阿森納在轉會市場上必須精打細算，在這之前，溫格的球隊連續八年聯賽排名前兩位。
2018年4月20日，阿森納官方宣佈溫格將在賽季末離任。這也意味著他22年的槍手主帥生涯走向了結束。溫格入主阿森納22年，為建酋長球場，在轉會市場上的淨投入只有1.36億英鎊，這其他豪門相比簡直不值一提。但是溫格憑藉這略顯寒磣的陣容，依舊連續19年進軍歐冠正賽，在每年的英超賽場也有上佳表現。從這一點上來說，教授無疑是偉大的。
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