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草甘膦藥劑防除雜草的效果，除了草甘膦本身的生物活性，即藥效的作用發揮以外，還與我們防除的雜草對象，施藥環境，和使用人的方式方法有關。
影響草甘膦除草效果的主要因素有：
一是雜草因素。草甘膦是莖葉除草劑，除草效果與雜草的株高和葉齡有關。實踐表明在雜草三至五葉一蕊時除草效果。因為此時雜草處於幼齡階段，生長才開始發育，比較柔嫩，再加上根系還不發達抗逆性差，但恰又對除草劑敏感，所以除草效果好。過此階段，雜草的抗逆性就逐漸增強，防除效果就下降。當然耐藥性雜草效果更差。
二是施藥的士壤條件：實踐中我們總結到土肥水條件好的地塊雜草生長旺盛，莖葉組織柔嫩，對除草劑敏感，除草效果就突出。反之在士層淺薄或乾旱的士壤中生長的雜草，
因為本身的生長環境惡劣，在生長過程中形成了對惡劣環境的抗逆性，莖葉表面的角質層增厚，植株葉片氣孔開張角度小，對除草劑的吸收性差，所以除草劑效果就差。
三是施藥時的氣溫。溫度是影響草甘膦除草劑除草效果的重要因素。草甘磷被雜草吸收後，溫度愈高其分生組織傳導藥劑的速度就愈快，根莖中累積的藥量就愈多，效果就愈明顯。在極端低溫氣侯條件，施用的除草劑往往效果差。
四是施藥時的空氣溼度。在高溼的空氣條件下噴施除草劑有利於雜草對除草劑的吸收。譬如，在雜草的旺盛期，雨晴初期時施用除草劑效果明顯。原因之一就是空氣的溼度較好。
五是光照對施用除草劑的影響。 草甘磷除草劑對雜草的作用，主要是綠色的莖葉部位。所以葉綠素的光合作用是其作用點之一。
一般情況在強光照射下，光合作用強烈，形成的光合作用產物就多，有利於除草劑的傳導及活性發揮。
六是降雨影響草甘膦的除草效果。如果施完草甘膦除草劑以後，六小時內遇雨就要視情斟情補噴。因為降雨可以沖洗噴施在植株葉片上的藥劑霧滴。
七是與使用除草劑的使用方式方法有關：譬如草甘膦只能作莖葉處理劑，不作土壤處理劑。也就是說草甘膦的除草用藥方式，只能是噴霧而不能用來拌士，作藥士使用。且勾兌藥劑時，不能用含泥質的水和硬度較高的井水。這些都是影響除草效果的重要原因。
八是施藥時風速，及雜草是否有露水也有關。風速可以改變藥滴的靶標方向，導致雜草不能受藥，所以雜草不能死亡。另外，施藥時雜草上的露水未乾，能有效降低除草劑的施用濃度，故仿除效果也差。
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