水月長安
這個問題貌似回答過。
安室透並不知道柯南時工藤新一。
安室透，在黑暗組織裡代號波本，以毛利小五郎徒弟的身份在毛利偵探事務所下面的咖啡店打工。而安室透的真實身份卻是潛伏於黑暗組織的日本公安降谷零。至於為什麼出現在柯南與毛利蘭的周圍，這就要歸功於貝爾摩德了。
在其中一個案件裡，安室透大顯身手取得了毛利一家的信任，對此貝爾摩德也跟安室透通過電話，其中有提到貝爾摩德與安室透的一個約定。
那麼，這個約定是什麼呢？聯繫到安室透的突然出現在柯南周圍，以及貝爾摩德對柯南與毛利蘭的態度。
可以想象到這樣一種可能，安室透的出現是貝爾摩德的手筆，貝爾摩德用一項情報或者線索誘使波本的潛伏。比如說在毛利偵探事務所會有你想要的線索等，與波本的約定是保護柯南與毛利蘭不受到傷害。
貝姐什麼樣的人，大家都知道，毛利蘭和柯南是貝姐唯二不願傷害的人，以當時波本的黑暗組織身份，貝姐一定不會告訴波本柯南的真實身份。而雪莉在黑暗組織裡的工作，製作的毒藥，波本也並不知道。在當時的波本看來，柯南也只是比較特別的小偵探而已。
確定波本不知道柯南真實身份的，還是灰原意外變回雪莉時，也就是《神秘列車》那一篇裡，大概在751-756集。
劇情裡因為灰原變回雪莉的事情意外被貝爾摩德和波本發現，貝爾摩德和波本佈局抓捕，當時的波本目的是抓到背叛者雪莉可以在黑暗組織裡得到信任換取更多情報，而貝爾摩德的目的確實想要將雪莉炸死。
然而卻沒有想到一切都在柯南的計劃中，在這趟列車裡可為風雲變幻，紅黑雙方你來我往，貝爾摩德與工藤有希子、波本與衝矢昂。。。
一切如柯南所料，波本以為快要抓到雪莉的時候才發現貝爾摩德的打算（安裝炸彈），炸彈爆炸，波本以為雪莉被炸死。列車到站，當貝爾摩德以為一切都成功的時候，灰原再次出現，原來當時的雪莉是怪盜基德假扮。以基德的能力自然輕鬆逃出。
這裡就透露出一個情報，波本並不知道灰原就是雪莉，不然波本一定會抓捕灰原的。所以在波本的認知裡，叛徒雪莉已經被炸死。而貝爾摩德再次輸給了柯南，也不會再透露給波本關於雪莉是灰原的事情。因為如果透露，以波本的能力，就會懷疑特別的偵探柯南的真實身份了。
所以，到目前為止，波本不知道柯南是消失的名偵探工藤新一。
MAN漫君
在我的印象裡或者是目前《名偵探柯南》所播放的劇集裡我都沒有看到過說安室透知道柯南就是工藤新一的劇集啊！唯一知道的就是柯南這個人很不尋常，不像是一個普通的小學生倒像是一個成年的大人。無論是從談吐，行為舉止或者日常表現都不覺著柯南是一個小學生，在柯南偵破代號為老鼠的那個女“幽靈寫手”就是殺人兇手，以及使用變聲器來模仿其他人的聲音以及其它劇集裡面柯南不尋常的舉動都可以證明柯南就是工藤新一的，最主要的一點是：每次有疑難案件時柯南都會尋求工藤新一的幫助而且還是在工藤新一不在的情況下。
風雲雄霸天
因為柯南的牛逼推理覺對會被人感覺奇怪，雖然我不常看名偵探柯南，……
Aend顏
零之執行人裡，安室透飆車前看見柯南和小蘭的對話，說，愛情的力量很偉大嘛～瞬間，我整個人都是懵掉的，安室透到底知不知道啊？
罵我的都是賤貨
畢竟人家也是公安部的臥底精英啊，就柯南的這些小動作和，超乎常人的推理能力，加上一定的調查很容易就被發現的
動漫小丑
零的執行人裡公安在柯南手機裡裝竊聽軟件，和阿笠博士、灰原哀的對話全都被安室看到、聽到了
(｡•́__ก̀｡)
第一次懷疑758集推理的波本，懷疑柯南和沉睡的毛利小五郎的關係
第二次懷疑787集朱蒂的回憶與賞花的陷阱，說那個男的真可怕
第三次懷疑832到836集緋色系列中
隔壁2花
安室已經知道了嗎？我不看漫畫，只看動畫，目前沒說安室知道了吧！他只是發現了柯南用變聲器破案，然後又發覺了柯南是赤井假死計劃的設計者之一，覺得他不同凡影響，但還不知道柯南是誰
搖了搖頭62014642
真相只有一個
