纯种繁育是保存蜜蜂物种基因库唯一正确的方法，所有蜜蜂地理亚种（品种）、生态型与生产型（品系），均要通过纯种繁育，达到保存和改良蜂种的目的。纯种繁育是在有效隔离的区域内，选择同一品种（品系）的优秀种群，培育蜂王和雄蜂进行交配，繁殖后代，并持久地进行世代繁育。选择、选配、近交、杂交与繁育是纯种选育的基本方法。
纯种繁育是蜜蜂育种的基石。拥有蜜蜂种质资源的很多国家，将本国蜜蜂品种的保存与改良，作为保护蜜蜂的基本策略和育种主要方向。诚然，养蜂家、育种家要善于从蜜蜂基因库获取有价值的育种材料，进行深层次和创新的育种工作。例如，俄罗斯奥廖尔蜜蜂科学研究所从 15～20 个州的很多蜂场引入品种资源，通过品质、生产力鉴定和定向选育，培育 44 个中俄罗斯蜂育成系，又反馈在养蜂地区推广应用。近 20 年来，美、德等国科技人员，加强了蜜蜂清除病虫尸卫生行为的鉴定和选育，培育出高产、抗幼虫病的意大利蜂和抗螨的卡尼鄂拉蜂。浙江农业大学和广大养蜂科技人员经 20 多年辛勤工作，选育王浆特别高产意大利蜜蜂新品系，促进了我国养蜂业发展和王浆专业化规模化生产。英国亚当在 20 世纪上半叶，选用英国黑蜂、意大利蜂、安纳托利亚蜂，应用育成杂交，培育成高产抗气管螨蜜蜂新品种布克法斯特（Buckfast）。前苏联蜜蜂科学研究所在 20 世纪下半叶，选用高山灰色高加索蜂、中俄罗斯蜂，通过育成杂交，培育成高产抗孢子虫病蜜蜂新品种普利奥科斯基（лриокский）。是享有世界声誉的高产抗寒抗病力强的蜜蜂新品种。
当前，世界养蜂业正面临严峻挑战，多个国家饲养的西方蜜蜂发生了蜂群崩溃蜜蜂消失的生存危机。蜂群崩溃综合症的发生，有外因和内因，有生态环境恶化和蜂种遗传基因问题，应当采取有力综合措施方能有效解决。要注重蜜蜂营养保健、蜂群科学饲养管理、病虫害农药中毒防治、抗螨抗病抗逆力强蜂种选育。生产用的蜂种，要严防因近亲繁殖带来的对蜂群的严重伤害，在蜜蜂种质资源的繁育上，要采用更为完善的繁育方法，如闭锁种群繁育和育成系综合繁育。这两种繁育方法，可使纯种经多个世代繁育的蜂群，具有更强生活力，更高生产力与育种价值，这对于我国蜜蜂种质资源的保存与繁育尤为重要。要知道，我国不是西方蜜蜂发源地，原来引进的一些优良品种种群数量有限，遗传背景单一，血缘关系不甚清楚，蜂种在经多个世代繁育，易发生近亲繁殖危害，导致品种衰退，一旦发生生态环境恶化或病虫害流行蔓延，我国蜜蜂种质资源很可能要蒙受重大损失。
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