1、前提定义
- H合伙型私募基金（有限合伙）
- S私募管理人（GP.有限公司）
- G公司投资人（LP.有限公司）
- Z投资人（LP.自然人）
- X1项目公司（有限公司）
- X2项目公司（有限公司）
S、G与Z以1:4:5的比例投资设立了H私募基金（合伙型），H分别投资了X1与X2两个项目，一年后H收到X2的分红款500万，并以转让的方式溢价1000万转让掉持有X1的全部股份。（H按投资比例进行利润分配，本文暂不讨论GP管理人的税收问题）
2、合伙型基金纳税义务人
合伙型私募基金虽说是基金，但同时本身也是一个合伙企业，所以相关的税收政策都按照合伙企业的规定标准执行。
3、缴税地点的确定
根据《国家税务总局关于发布的公告》（国家税务总局公告2014年第67号）第十九条规定，若转让方为法人和其他组织，应在机构所在地地税机关办理相关事宜。
由此可得，合伙企业为其他组织，应在合伙企业所在地办理，但合伙企业视为透明，则按照自然人和法人拆开开看，自然人Z在H合伙企业所在地办理，G公司应在G所在地办理。
4
法人合伙人是否存在重复征税
根据《中华人民共和国企业所得税法》（中华人民共和国主席令第63号）第二十六条规定，符合条件的居民企业之间的股息、红利等权益性投资收益为免税收入。对于G公司投资人，因为它不是直接投资给居民企业，而是通过H合伙企业间接投资给居民企业项目公司的，税局认为中间有个H合伙企业，因此不属于免税收入，故G公司还要再缴25%企业所得税。注：这样其实缴了三道税，项目公司X1缴了一道企业所得税，G公司又缴一道企业所得税，G公司股东若是个人，还要再缴一道个人所得税，有限合伙企业作为税收透明体不缴税。重复纳税不合理，但税法规定如此。但有些地区有人性化的处理，实务中建议与税局沟通，看能否将合伙企业视为税收透明度体，获得直接投资免税认同。
5
合伙企业“先分后税”解释
财税〔2008〕159号文件第三条规定，合伙企业生产经营所得和其他所得采取“先分后税”的原则。前款所称生产经营所得和其他所得，包括合伙企业分配给所有合伙人的所得和企业当年留存的所得（利润）。
根据上述规定，作为有限合伙企业的合伙人，不论合伙企业是否分利润，只要其有留存利润，该部分的留存利润也应先按合伙协议约定比例或者按投资比例的分配，也就是先按比例分成该有份数，然后按照各自的份数额度各自纳税，并不是说先分到各自手里才有纳税义务，而是说不管到不到手，先把所得分了，再按各自适用税率计算缴税。步骤如下：
1、合伙企业计算先按照个体工商户计算所得的办法计算出应纳税所得额。
2、计算出的所得无论是否实际分配到位，全部按照合伙协议或约定比例计算出合伙人各自的所得。
3、合伙人是自然人的，缴纳个人所得税，合伙人是法人和其他组织的，计入法人企业当年的应纳税所得额计算缴纳企业所得税。
6
股息分红
根据《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定〉执行口径的通知》（国税函〔2001〕84号）第二条规定：个人独资企业和合伙企业对外投资分回的利息或者股息、红利，“不并入企业的收入”，而“应单独作为投资者个人”取得的利息、股息、红利所得，按“利息、股息、红利所得”应税项目计算缴纳个人所得税。
H基金收到的500万分红款，不并入合伙企业的其他收入中，而是直接按比例分给Z投资人250万，由Z按20%税率缴个人所得税，（因 “利息、股息、红利所得”适用比例税率，税率为20%）。200万分给G公司，并入应纳税所得缴25%企业所得税。
7
股权转让溢价所得
《财政部 国家税务总局关于印发的通知》（财税〔2000〕91号）规定：第四条 个人独资企业和合伙企业（以下简称企业）每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，作为投资者个人的生产经营所得，比照个人所得税法的“个体工商户的生产经营所得”应税项目，适用5%～35%的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。有些地方为了鼓励股权投资，对“合伙型股权投资基金中个人投资者取得的收益”按“财产转让所得”征收20%的个人所得税。
8
税收筹划
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