甜瓜种植要想高产，首先需要培育健壮幼苗，而在甜瓜育苗期间常伴有猝倒病、立枯病、炭疽病和沤根等病害威胁。及时防治苗期病害，控制其危害程度，是培育壮苗、全苗、获得丰产的至关重要。
3、种子处理。播种前将种子放在55℃温水中浸泡10～15分钟、或高锰酸钾1000 倍液浸泡3～5分钟、或10%磷酸三钠浸种30分钟、或用种子重量的0.4%克菌丹拌种，均是春季育苗中预防猝倒病、立枯病等苗期病害的有效措施。
4、苗床管理。以降低苗床湿度为中心，为幼苗创造良好生长条件，增强抗病能力，促进幼苗生长。一是施足腐熟优质有机肥，采用营养土育苗。播种要均匀，密度适宜。二是合理用水，播种前浇足底水，出苗后尽量不浇水或少浇水。需要浇水时可用喷壶轻浇，以免湿度过大。若苗床出现过湿情况，可用小锄划锄或撒施干草木灰，以降低湿度。三是加强温度管理，育苗室白天控温20～25℃，夜间15℃，最低不低于12℃。苗床要尽量增加光照，并注意通风、降湿，尤其是在连续阴天、光照不足时，更要抓紧时机通风降湿。要坚持每天仔细观察苗情，一旦发现中心病株，立即拔除，并向穴内撒生石灰或药土(70% 甲基托布津1份，土50 份拌均)进行局部消毒，防止病菌蔓延。
5、药剂防治。如果床土未经药剂处理，或虽经药剂处理，但出苗后仍发现少数病苗时，首先拔除病苗，并用药剂进行防治。如是猝倒病可用75% 百菌清可湿性粉剂600 倍液、或46% 杀毒矾可湿性粉剂500倍液，每隔7～10天喷施1次，连续2～3 次。立枯病发病初期喷20%甲基立枯磷乳油1200倍液、或36%甲基硫菌灵悬浮液500倍液、或15%恶霉灵水剂450倍液，每隔7～10天喷1次，连续2～3 次。若猝倒病和立枯病并发，用72.2%普力克水剂800倍液加50%福美双可湿性粉剂800 倍液，每隔7～10 天喷施1 次，连续2～3 次。炭疽病用65%代森锰锌可湿性粉剂500 倍液、或80% 炭疽福美可湿性粉剂800 倍液、或50% 扑海因可湿性粉剂1000～1500 倍液，7～10 天喷1次，连续2～3 次。喷药时混入微肥或喷施宝等叶肥效果更佳。