从增值税的税负成本角度来看，13个点的进项发票和3个点的进项发票对一般纳税人的增值税的税负成本是一样的效果。
但是，取得13个点的专票，相对来说更为有利。
从门面上看，取得进项发票的税率不一致，确实会导致增值税税负不一致。
某食品有限公司系一般纳税人，假设在2019年9月从小规模纳税人处购进货物100万元，取得的3%征收率的进项税额3万元，当月加工后销售出去，取得销售额200万元，发生销项税额200×13%=26万元，那么9月应交增值税26-3=23万元。
若2019年9月是从一般纳税人取得进项发票100万元，进项税额13万元，当月应交增值税26-13=13万元。
看的出来啊，若取得的是3个点的专票，应交增值税23万元，增值税税负率为23÷200×100%=11.5%。
若取得的是13个点的专票，应交增值税13万元，增值税税负率为13÷200×100%=6.5%。
这么看来，税负差距还是挺大的。
既然增值税税负率有差距，为什么增值税的税负成本又没差别呢？
这里不得不说增值税的一个天才设计，那就是增值税是价外税，可以层层转嫁。
按上面提到的案例给你分析一下你就明白了。
我们先分析3个点的专票。你进货支付了进项税额3万元，发生销项税26万元，应交增值税为23万元，那么这个流程用通俗易懂的语言描述就是这样的：你购货垫付了税款3万元，这3万元由你的上游交给了税务局，然后你销货时又从你的下游收回来税款26万元，扣除你垫付的税款3万元，你向税务局交了23万元税款。
如果你取得的是13个点的进项发票，那就是你先垫付了税款13万元，又从你的下游收回来税款26万元，扣除你垫付的13万元，应向税务局上交13万元。
看出问题来没？不管你是3个点的专票还是13个点的专票，实际上都是自己先垫钱进去，然后又从你的下游把钱收了回来，差额部分交给税务局，在增值税的这个流程中，你实际上没有负担一分钱。
3个点的专票和13 个点的专票对税负的影响差别在哪？
这个差别其实在增值税的附征，也就是会影响到城市维护建设税、教育费附加、地方教育费附加的负担。
以上面3个点专票为例，当月应交增值税23万元，那么应交：
城市维护建设税应交23×7%=1.61万元；
教育费附加23×3%=0.69万元；
地方教育附加23×2%=0.46万元。
合计应交附加税费1.61+0.69+0.46=2.76万元。
以13个点的专票为例，当月应交增值税13万元，那么应交：
城市维护建设税应交13×7%=0.91万元；
教育费附加13×3%=0.39万元；
地方教育附加13×2%=0.26万元。
合计应交附加税费0.91+0.39+0.26=1.56万元。
所以，真正的差异其实在这，取得13个点的专票可以减少附加税费的支出，附加税费是要进入到企业成本费用的，会影响企业的利润，所以，一般纳税人更喜欢13个点的专票，不太愿意跟小规模纳税人合作，因为小规模纳税人只能开3个点的专票。
所以，如果是一般纳税人在选择进货渠道的时候，尽量还是要选择同样是一般纳税人身份的公司合作，因为这确实会影响到公司挣钱的多少。