3篇論文報告了人類微生物組整合計劃的研究成果

原創 Nature自然科研 Nature自然科研 2019-05-30

3篇論文報告了人類微生物組整合計劃的研究成果

本週《自然》和《自然-醫學》在線發表了人類微生物組整合計劃(iHMP)的三篇論文,概述了宿主和微生物組之間的互作如何影響人體健康。iHMP調查了在炎症性腸病(IBD)、前驅糖尿病、懷孕和早產中,微生物組和宿主的變化。所得發現有助於表徵這些疾病,預測病人轉歸,將來或許還能促進治療。

人體微生物組因個體、群體和環境而異,並且已知會影響人類的健康和疾病狀態。iHMP採用多組學方法探索了微生物組和宿主的時間動態變化(如免疫響應和新陳代謝),以便理解這些疾病中的微生物-宿主互作。



美國哈佛大學陳曾熙公共衛生學院的Curtis Huttenhower及同事研究了132名IBD患者和健康的對照組被試。在第一篇《自然》論文Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases中,作者鑑定出了微生物組組成的變化、腸道內宿主源和微生物組源分子的變化以及基因表達的轉變。作者總結表示,這項研究對IBD中的宿主和微生物活動進行了迄今為止最全面的描述,有望為理解疾病發病和進展帶來深刻見解。

3篇論文報告了人類微生物組整合計劃的研究成果

在IBDMDB研究中 IBD微生物的多組學分析

Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases



在第二篇《自然》論文Longitudinal multi-omics of host–microbe dynamics in prediabetes中,美國斯坦福大學醫學院的Michael Snyder小組報告了前驅糖尿病中宿主和微生物組之間的互作。前驅糖尿病會導致糖尿病,但是經常得不到確診。研究小組對106名健康個體和前驅糖尿病個體進行了為期4年的研究,分析了分子變化、遺傳變化和微生物變化。他們發現了可以定義早期疾病發展的規律——在某些情況下,這可能有助於及早檢測出2型糖尿病。

3篇論文報告了人類微生物組整合計劃的研究成果

研究設計摘要及群組細節和數據

Longitudinal multi-omics of host– microbe dynamics in prediabetes



發表在《自然-醫學》上的論文The vaginal microbiome and preterm birth則描述了陰道微生物對於早產風險(全球早產率超過10%)的影響。美國弗吉尼亞聯邦大學的Gregory Buck及同事在1,527名孕婦的整個孕期內對其進行了研究,揭示了與早產(不足37周)風險相關的陰道微生物組變化,尤其是對非洲裔婦女而言。例如,研究發現早產孕婦的捲曲乳桿菌(Lactobacillus crispatus)水平低於足月妊娠的孕婦,而過去的研究已經表明捲曲乳桿菌與婦女健康有關。他們還在早產孕婦體內發現了大量過度存在的不同種類細菌。這項研究或許有助於未來提前預測早產。

3篇論文報告了人類微生物組整合計劃的研究成果

MOMS-PI研究數據

來源:Fettweis et al.

The vaginal microbiome and preterm birth



另外也有一篇“觀點”文章What’s next for the human microbiome?和一篇“評論”文章The Integrative Human Microbiome Project討論了人類微生物組整合計劃。

nature|doi:10.1038/s41586-019-1237-9

nature|doi:10.1038/s41586-019-1236-x

nm|doi:10.1038/s41591-019-0450-2

nature|doi:10.1038/s41586-019-1238-8

nature|doi:10.1038/d41586-019-01654-0


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