獸醫處方是為了達到治療的目的，而採取的兩種或兩種以上不同藥物、不同類別藥物、不同功能藥物同時或先後應用，其結果主要是為了增加藥物的療效或為了減輕藥物的毒副作用，但有時也可能會產生相反的結果。
因此，獸醫臨床合理配伍下的處方，應以提高療效和（或）降低動物對藥物的不良反應為基本原則。處方中各個藥物之間的相互作用審視，應包括對影響藥動學的相互作用、影響藥效學的相互作用、影響藥物穩定性的相互作用等審查。
另外，處方中使用的藥物的品類、品種越多，將會使得藥物間相互作用降效的發生概率顯著增加，影響藥物療效或毒性的因素增加。所以說，在給患病動物用藥時，應小心嚴謹，儘量減少用藥的種、類，避免因藥物相互作用而引起的不良反應事件的發生。
影響藥動學的相互作用
①吸收：例如維生素C有助於鐵劑中Fe2+的吸收；四環素與Fe2+、Ca2+等重金屬離子的藥物同時服用時，可因絡合反應而影響各自的吸收，應避免同服。
②分佈：例如解熱鎮痛藥卡巴匹林鈣與口服抗凝藥共同使用時，可能會因為競爭血漿蛋白的結合，使得遊離型的抗凝藥增加，導致凝血過度，而發生出血風險。
③轉化：多種藥物同時使用時，肝藥酶誘導劑加速藥物在肝臟中的轉化，使得藥效降低。肝藥酶抑制劑則相反，能使得藥效增強，甚至發生中毒。
④排洩：例如弱鹼性藥物苯巴比妥過量時，碳酸氫鈉鹼化尿液可促進磺胺藥的溶解，從而加快藥物的排除以解毒；避免因磺胺藥遇酸性尿液析出、沉積在輸尿管內，造成輸尿管堵塞和腎腫事故的發生。
影響藥效學的相互作用
主要表現為協同（例如：青黴素類藥物或頭孢類藥物與氨基糖苷類藥物合用）、相加或拮抗作用（青黴素類藥物或頭孢類藥物與林可黴素類藥物合用）。
藥物相互作用很重要的一個方面就是——配伍禁忌。藥物在體外直接配伍使用時，所發生的的物理性或化學性的相互作用，成為理化配伍禁忌。
抗菌藥物聯合用藥原則
首先，單一藥物可有效治療的感染不需聯合用藥，僅在下列指徵情況時才聯合用藥。
一是，病原菌尚未查明的嚴重感染，包括免疫缺陷者的嚴重感染。
二是，單一抗菌藥物不能控制的嚴重感染，或需氧菌及厭氧菌混合感染，兩種及兩種以上覆合病原菌感染，以及多重耐藥菌或泛耐藥菌感染。
三是，需長療程治療，但病原菌易對某些抗菌藥物產生耐藥性的感染。比如說，某些侵襲性真菌病；或病原菌含有不同生長特點的菌群，需要應用不同抗菌機制的藥物聯合使用才有效。
四是，毒性較大的抗菌藥物，聯合用藥時，劑量可適當減少，但需有臨床資料證明其同樣有效。
其次，聯合用藥時，宜選用具有協同或相加作用的藥物進行聯合。比如說，把青黴素類、頭孢菌素類或其他β-內酰胺類藥品與氨基糖苷類藥品聯合。
中獸藥的聯合用藥原則
中獸藥聯合內服使用。主要是指證疾病複雜時，一箇中獸藥不能滿足所有證候時，可以聯合應用多種中獸藥。當多種中獸藥的聯合應用時，應遵循藥效互補原則及增效減毒原則。功能相同或基本相同的中獸藥，原則上不宜疊加使用。藥性峻烈的或含毒性成分的藥物，應避免重複使用。合併用藥時，注意中獸藥的各藥味、各成分間的配伍禁忌。一些病證，可採用中獸藥的飲水內服與拌料內服用藥，這種多途徑雙內服使用為“獨創應用”。
中藥注射劑聯合原則。當兩種以上中藥注射劑聯合使用時，應遵循主治功效互補及增效減毒原則，符合中醫傳統配伍理論的要求，無配伍禁忌。獸醫治療臨床聯合用藥須謹慎，如確需聯合使用時，應謹慎考慮中藥注射劑的間隔時間以及藥物相互作用等問題。若需同時使用兩種或兩種以上中藥注射劑，嚴禁混合配伍，應分開使用。除有特殊說明，中藥注射劑不宜兩個或兩個以上品種同時共用一給藥通道。
再者，中獸藥與西藥的聯合使用問題。針對具體疾病制定用藥方案時，要充分考慮中西藥物的主輔地位後，再確定給藥劑量、給藥時間、給藥途徑。中獸藥與西藥如無明確禁忌，可以聯合應用，給藥途徑相同的，應分開使用。應避免副作用相似的中西藥聯合使用，也應避免有不良相互作用的中西藥聯合使用。
特別要強調的是：中西藥注射劑聯合使用時，還應遵循以下原則。
一是，聯合使用須謹慎。如果中西藥注射劑確需聯合用藥，應根據中西醫診斷和各自的用藥原則選藥，充分考慮藥物之間的相互作用，儘可能減少聯用藥物的種數和劑量，根據臨床情況及時調整用藥。
二是，中西注射劑聯用，儘可能選擇不同的給藥途徑（如肌肉注射、靜脈注射、噴霧給藥等）。若必須同一途徑用藥時，應將中西藥分開使用，慎重考慮兩種注射劑的使用間隔時間以及藥物相互作用，嚴禁混合配伍一起注射。
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