1. 急性肾炎 当过敏性紫癜性肾炎发生于皮疹已经消退时要与急性肾炎相鉴别。此时追问病史，包括回顾皮疹形态、分布、关节和胃肠道症状有助于本病的诊断。缺乏上述症状，早期有血清补体降低有助于急性肾炎的诊断。必要时可做肾活检做鉴别。
2. Coodpasture综合症 当过敏性紫癜性肾炎常伴有出血、咳血时应注意与此病鉴别。由于本病有典型的皮疹和关节炎，胃肠道症状。血清IgA增高等，鉴别并不困难，必要时做肾活检，两者有截然不同免疫荧光表现，Coodpasture综合症免疫荧光为典型的IgG沉积。
3. 狼疮性肾炎 由于系统性红斑狼疮可有皮疹、关节炎和肾损害，应该与此病鉴别，但两者皮疹形态和分布上均有显著区别，诊断并不困难。两者肾活检有不同之处，如免疫荧光检查，狼疮性肾炎虽然也有IgA沉积，但常有大量的其他免疫蛋白沉积，且有C1q沉积，肾小管毛细血管壁白金环样变也有助于鉴别。两者皮肤活检也不同，狼疮性肾炎可见狼疮带，而过敏性紫癜性肾炎可见IgA沿小管壁沉积。
4.多动脉炎 此病临床上类似过敏性紫癜性肾炎，但血清IgA多不增高，皮肤与肾活检也无IgA沉积，免疫荧光除纤维蛋白外均为阴性，见于5~15岁儿童。
5. IgA肾病 在临床上与过敏性紫癜性肾炎不同，但组织性检查却十分相似，均可有皮肤小血管IgA沉积，近几年有报道仅有的区别是过敏性紫癜性肾炎在肾组织上常存在单核细胞和T淋巴细胞，而IgA肾病肾组织却无此类细胞。
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