作者丨小柯
美国霍华德休斯医学研究所Zhe Liu、加州大学伯克利分校Robert Tjian等研究人员合作，开发了用于可及性基因组超分辨成像的新型显微镜。
这一研究成果于2020年3月16日在线发表在《自然—方法学》上。
为了在纳米尺度上对可及性基因组进行原位成像，研究人员开发了转座酶可及性染色质光激活定位显微镜（3D ATAC-PALM），其将转座酶可及性染色质测定与可视化、PALM超分辨率成像以及晶格光片显微镜整合在一起。
3D ATAC-PALM与oligopaint DNA-荧光原位杂交（FISH）、RNA-FISH和蛋白质荧光多路复用，连接了显微镜和基因组数据，从而揭示了空间分隔的可及染色质域（ACD），其中包含活性染色质和转录的基因。
使用这些方法来分析遗传扰动的细胞，研究人员证明了基因组结构蛋白CTCF可以防止可及性染色质过度聚集并破坏ACD。
这些结果突显出3D ATAC-PALM是一种有用的工具，可探测基因组的结构和组织机制。
https://www.nature.com/articles/s41592-020-0775-2
小柯报道：
http://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/2020/3/202031813261027655456.shtm
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