當我們產生一個想法時，比如考慮吃什麼或者與朋友談話時，我們幾乎總是立即開始主觀的在生活中其他方面的背景中考慮這件事情。在很多情況下這很有用，但有時這也會使我們犯強迫症，尤其是對於那些容易焦慮和抑鬱的人。
正念冥想和一些抑鬱症治療法的目的之一是“去主觀化的我執（Decentering）”，它的目的是進入這樣一種思維狀態，人們可以將想法和感覺視作暫時的客觀事件。
一項對嚴重抑鬱患者的研究表明，去主觀化能力與疾病複發率下降相關，並且會提升生活滿意度和幸福感。
當我們進入一間安靜的房間並且使大腦保持空白一段時間之後，我們進入強烈專注狀態會更容易。
威斯康星大學的神經科學家Richard Davidson在一項長期研究中對多年堅持冥想的人和剛剛開始冥想的人進行了比較。他發現，當他試圖驚嚇這兩組受試者時，前者受到的影響要比後者小的多（無論他們是否接受過這種驚嚇練習）。
大部分人的腦子中都會有憂慮和擔心的事情。我們常常會把這些想法放在一邊而不去處理它們可能產生的感覺。
無論是每天為自己準備一個實體空間還是思維空間來清理大腦中的雜念，都能夠幫助我們處理這些負面情緒。
一份涉及3000人的研究回顧發現，正念冥想能夠降低抑鬱、焦慮甚至是疼痛的感覺。
有經驗的冥想者的大腦似乎更加獨特，其意識和情緒控制的大腦區域發育的更好。即使是剛剛開始冥想的人，一些研究也表明冥想練習可以顯著改善與記憶、視野和自我意識相關的大腦區域。
威斯康辛大學的神經學家Richard Davidson主導了一項為期12年的研究，在研究中他對冥想高手和冥想初修者進行了比較，在實驗過程中他會用一些聲音驚嚇受試者，這也是研究的一部分。
Davidson在這兩組受試者中觀察到，與“同理心（empathy）”有關的兩個大腦區域活動性增強，但是對於冥想高手來說這種作用更明顯。這表明，經常進行冥想的人會增強對其他人的感覺的反應能力，因為能感同身受，所以不會不知所措。
研究表明，定期冥想可以使血壓降低。這似乎是由於冥想能夠降低應激激素的水平，本身這種激素會導致炎症和其他身體問題。
在2017年1月的一項研究中，研究人員招募了12個24至76歲之間的受試者，他們參加了為期一週的“心靈靜修”，包括靜靜地沉思和冥想。研究人員在試驗開始前後對他們的大腦進行了掃描，觀察兩種與情緒相關的化學物質的活動，即多巴胺和血清素。
他們還對受試者的健康、壓力和疲勞等情況進行了測量。靜修之後，受試者的測量結果表明，他們的身體健康狀態得到顯著改善，而壓力和疲勞等負面感覺減輕。靜修前後的大腦掃描表明，多巴胺和血清素轉運體綁定減少，而這會使大腦有更多可用的神經遞質。
在一項研究中，研究人員招募了兩組受試者，其中一組接受為期8周的冥想訓練。最後，研究人員對兩組受試者注射流感疫苗並通過測量流感抗體的方式檢查他們的免疫反應。試驗組的免疫反應比對照組明顯更強，這表明他們的免疫系統對抗攻擊的能力更強。
還有證據表明，定期冥想可以防止某些基因損傷
一項對完成了冥想練習的癌症倖存者的研究表明，受試者的染色體終端（一種保護DNA的蛋白複合體）變長了。研究人員認為，可能的機制是，減輕壓力能夠在某種程度上導致端粒延長，但是還需要更多的研究來驗證這一結論。
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