實務工作中，稅務機關在進行稅收風險評估時一般會將增值稅稅負和企業所得稅稅負作為其中的一個參考值，同時還考慮行業因素等。在納稅評估和稅務檢查過程中，也會詢問納稅人稅負偏低的原因。由於企業經營情況和盈利能力千差萬別，增值稅、企業所得稅稅負低並不表示企業就有稅收風險。下面就企業採購成本與增值稅稅負、企業所得稅稅負問題簡要分析如下：
一、關於稅務機關增值稅、企業所得稅稅負預警提醒問題。稅務機關問對稅負提出的一些疑問只是瞭解你稅負低的原因，做一個稅負分析，不是徵稅的依據，也不會影響你的信用等級。即使你的稅負低於稅務機關的預警值，只要能解釋清楚就沒有問題了。因為增值稅稅負與企業的盈利能力、獲得進項稅額的結構等關係緊密，稅負自然有高有低。
二、實際採購成本與應繳稅負的關係問題
一是採購成本高，如果一般納稅人均能取得增值稅進項稅額，有利於降低增值稅稅負。同時採購成本高，會影響企業的盈利能力，相應企業所得稅稅負也不會高，比如實務中很多商貿企業，由於毛利率低，可能增值稅稅負和企業所得稅稅負均較低也是正常的。
二是產品的毛利率高，盈利能力強，則增值稅稅負就會高，反之，則增值稅稅負低。同時盈利能力高低也會影響企業所得稅稅負。
三是無論增值稅稅負還是企業所得稅稅負還與企業是否享受相關增值稅和企業所得稅優惠政策有關，優惠政策越多越大，影響越大。
三、根據上述分析，建議納稅人沒必要為稅負低糾結。因為稅負僅僅是稅務機關稅收風險分析的參考指標之一。稅負低的企業只要按稅法規定依法納稅就沒有問題。相反稅負高的企業也不一定表示就沒有問題。歸根結底，依照稅法規定依法納稅就沒有大的稅收風險。
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