對於CD4+T淋巴細胞計數較低的HIV感染者，啟動抗病毒治療前數月有可能因為免疫功能恢復而導致炎症反應增強。HIV感染者在抗病毒治療前數週或前數月，由於CD4+T淋巴細胞計數增高，可能對引起機會性感染的病原體的免疫反應增高，可以表現為一種新的或更惡化的臨床疾病。
在開始抗病毒治療後，HIV感染者可能出現下列2種類型免疫重建炎性綜合徵（IRIS）中的任意一種：
①“治療矛盾反應”：在抗病毒治療開始後出現的與治療相關的疾病［例如結核病或念珠菌（假絲酵母菌）病］矛盾性地變得更加嚴重；
②“暴露型”IRIS：免疫功能恢復後使得原先隱匿的感染出現明顯臨床表現。
免疫重建炎性綜合徵（IRIS）的臨床疾病譜包括
- 發熱、
- 淋巴結腫大、
- 肺及中樞神經系統病變、
- 皮疹、
- 急性肝炎
- 他機會性感染
IRIS的典型起始時間為抗病毒治療開始後的前8周內的任何時間，但也有觀察到直至6個月才出現。在初始治療失敗併成功地調整為二線藥物治療時，IRIS也可出現。IRIS可輕可重。為降低IRIS的風險，在開始抗病毒治療前積極處理或使活動的機會性感染穩定下來十分重要。
當疑似IRIS時，應按照下列順序處理：
①處理侵襲性的機會性感染；
②使用非甾體類抗感染藥（NSAIDs）或短期使用皮質激素以減輕炎症反應；
③多數HIV感染者無須中斷抗病毒治療。對於嚴重的IRIS HIV感染者，NSAIDs或口服皮質激素［潑尼松，1mg/（kg·d），1～2周後再逐步減量並停用］有助於減輕炎症反應及穩定病情。CD4+T淋巴細胞計數低的HIV感染者及嚴重的IRIS病例應住院並由HIV治療專家來進行處理。
在抗結核治療8周後再開始抗病毒治療有助於降低出現結核性IRIS的風險。對於極度虛弱的HIV感染者，儘管在處理機會性感染後不久、結核治療過程中以及病情剛剛穩定的時候開始進行抗病毒治療會增加發生IRIS的風險，但是這種治療方案對HIV感染者也許有益。
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