多年以來努爾哈赤的死因，一般被歸為三種：第一死於炮傷，第二死於疾病，第三就是死於炮傷加疾病。即便到了今天，在國家清史編纂委員會的編纂過程中，這個問題也還是引發了專家們的種種爭議。
究竟有怎樣的資料可供參考理性分析，而非道聽途說甚至憑空臆測，這是我們亟待解決的問題。
讓我們先看一下當初的寧遠之戰。
寧遠之戰
天命十一年正月，努爾哈赤發動了寧遠之戰，並於正月二十三日抵達寧遠城下，剛到城下就遭到明軍火炮的猛烈攻擊，死傷數十人，無奈之下努爾哈赤又把大營改設在城西一側，並撤到明軍大炮射程之外，炸營借債不多贅述。
二十四日，在努爾哈赤的指揮下對寧遠發起了猛烈的攻擊，首先遭受攻擊的是城牆的西南角，明軍充分利用了火球、火把、箭矢有效阻止了後金軍隊對城池的攻擊，後金軍損失慘重，而明軍據城作戰，居高臨下，所以損失較少。這場戰鬥一直持續到當晚的十一點左右，後金軍人困馬乏，進攻無法繼續進行，無奈之下努爾哈赤下令收兵。
這一天，沒有努爾哈赤受傷的任何記錄。
二十五日，努爾哈赤親自指揮，細節不講，直到深夜仍未停止，面對著城堅炮厲，後金軍隊的傷亡數字不斷擴大，在高大的城牆前，卻無計可施，進攻沒有任何進展。努爾哈赤只能再次下令停止進攻，紮營休整。
這一天，沒有努爾哈赤受傷的任何記錄。
總結來看，兩天的攻城行動都是努爾哈赤親自指揮，但都以失敗告終。一直到二十六日，眼見攻城無望的努爾哈赤放棄寧遠，單獨抽調一支軍隊進攻覺華島，這是個退而求其次的選擇，不能對明軍直接造成傷害，那也只能儘量毀掉明軍的屯糧、軍備據點，此時的明軍在覺華島駐紮7000人左右，因海面結冰，距離寧遠城又很近，所以騎兵包住馬蹄飛馳而過全殲大明官兵，並奪取了島上的一切戰略物資。
這一天，沒有努爾哈赤受傷的任何記錄。
正月二十七日，努爾哈赤徹底放棄寧遠城的攻擊，下令撤退並於二月初九日回到瀋陽。
嚮明廷奏報情況
寧遠軍方是如何向皇帝奏報的呢？正月二十四日後金首次發起進攻。
二十五日，後軍再次發起進攻，努爾哈赤親自持長刀督陣，驅使後金士兵衝鋒攻城，但士兵僅僅跑到城下就無功而返，在此期間明軍的滾木、礌石、箭矢、炮火在或遠或近的距離同時發揮了有效的打擊作用。
二十六日，努爾哈赤分兵攻擊覺華島，官兵死傷7000多人，後金軍不分商戶、平民、男女老少全部殺害，氣焰非常囂張，這是因為攻打寧遠不成，所以遷怒於覺華島。
總結可見的幾乎所有文字記錄，努爾哈赤在寧遠之戰從二十三日到場，到突襲覺華島，直至回到瀋陽，全都是努爾哈赤在親自指揮，做為主帥揮師攻城的努爾哈赤，既沒有受傷記錄，也沒有絲毫受傷的跡象，一般來說如果主帥受傷，隨行的諸王貝勒不可能繼續作戰而不顧一個老人的生死，幾乎所有時間，袁崇煥在，努爾哈赤也在，而未見袁督有過對方更換指揮官的記錄。
奏報傷亡記錄：
明朝的統計是：後金士兵死亡數千，軍官數人，酋子一人。
經略高第：槍斃一大頭目，用紅布包裹，從賊抬雲，放聲大哭。
求子是誰呢？根據《明史紀事本末補遺》：努爾哈赤長孫哈兔。（具體是不是所謂的哈兔，不得而知）
官史、紀事本末、明季北略都沒有記錄過努爾哈赤遭受炮擊的情況。
酋子也好，大頭目也罷，這都不是問題的關鍵，關鍵是他們所敘述的都不是努爾哈赤。因為從相應文獻記錄來看，從來沒有把努爾哈赤成為“酋子”或“大頭目”的記錄，三者不可能混淆，簡單說，從來沒有大頭目努爾哈赤，或者酋子努爾哈赤的文字記錄。
所以說根據當時的文獻記錄。無論受傷還是死亡，都不可能是努爾哈赤本人。
後金記錄：士兵損傷我們不管。損失的軍官只有4人而已，只是遊擊將軍，職位並不算高。
努爾哈赤被炮轟的說法由何而來
猜測來源一、《石匱書後集》曾經記錄：炮彈射出之後，直接轟在了黃龍幕附近，傷一裨王，以皮革裹屍號哭奔去。
有的學者就把這位裨王，當做了努爾哈赤本人，但同樣的原因，沒有任何文獻記錄把努爾哈赤稱為裨王。
猜測來源二、臆測者覺得努爾哈赤攻城兩天就宣告撤兵，其中必有變數，說不定就是努爾哈赤身受重傷，這是完全沒有根據的。
努爾哈赤有著豐富的戰爭經驗，對於這種難以攻克的城池，他不會憑一時意氣，靠匹夫之勇持續攻城，從戰鬥初期就可看出，努爾哈赤的行動很明確，攻城戰而絕非圍困戰，面對毫無建功希望的寧遠城，退兵的舉動並不突兀。
猜測來源三、朝鮮翻譯官韓瑗的說法是絕不靠譜的。
韓瑗到過寧遠，還拜見過袁崇煥，只見袁崇煥談古論今，臉上沒有任何擔憂的神色，不多久，城頭放響一炮，地動山搖，袁崇煥笑著說，敵人到了，開窗，看到賊兵......
根據韓瑗的記錄，二十四日，一直持續到晚上雙方激戰，但他沒有描寫努爾哈赤是否受傷。
轉天清晨見到袁崇煥，突然提起努爾哈赤昨天已受重傷，這一點令人起疑。
韓瑗本人也從來沒寫過努爾哈赤曾經受傷的這個情況，這句話說的非常突兀，這麼重要的事情，作為敵軍首領，如果前日受傷，為何只字不提，只是在事後才提及已受重傷呢，毫無道理。
沒有日期，沒有時間地點人物，沒有一切描述，努爾哈赤就傷了，從來沒有這種寫法，大段的戰場描述偏偏少這幾個字麼。
自相矛盾的是，韓瑗文末又寫過一句話，努爾哈赤寧遠失敗，活活被氣死，更是前言不搭後語。但是我們卻可以從這段記錄看出，韓瑗是在努爾哈赤死後才寫這些的，而並非當時。
如果韓瑗能看到的話，袁崇煥當然會對這件事更加清楚，但是對明廷的奏報上卻隻字未提，這對於好大喜功的袁崇煥來說是不可能的。反倒是袁崇煥實事求是，沒有編造擊傷或者打死努爾哈赤的謊言。
袁崇煥並沒有像韓瑗一樣扯謊，因為他知道在這裡扯謊的話，事後面臨的就是--一旦努爾哈赤再次率兵來襲，該怎麼解釋死而復生的努爾哈赤呢。
攻擊寧遠的時候努爾哈赤已經68歲，當時他的兒孫必定是簇擁左右，明朝的大炮再準，也不可能準到只擊傷努爾哈赤本人，而其他比如代善或皇太極毫髮無傷的水平。
努爾哈赤有著豐富的戰鬥經驗，對於火炮的射程也相當瞭解，從他二十四日扎帳結營開始就非常清楚火炮的射擊距離，在這種情況下作為統軍主帥，他不會主動走入明軍的射程之內。
從受傷到去世中間相隔了7個多月
努爾哈赤從寧遠敗回瀋陽，僅僅不到兩個月的時間，於同年四月初四就帶領自己的子孫，統率大軍數萬遠征喀爾喀蒙古，一直到五月初一，努爾哈赤親自舉行儀式受降。
路程情況：往返需要2000裡，如果努爾哈赤受傷的話，這是不可能完成的任務，這次軍事行動足足持續了一個月的時間，後來的努爾哈赤還親自參與了科爾沁蒙古的結盟活動。這都不是一個傷重老人能做出來的。
《滿文老檔》、《滿洲實錄》、《清太祖實錄》加上袁崇煥與毛帥的奏報，都將努爾哈赤的死因指向惡瘡、背疽。
前三部史料的記錄幾乎完全相同，努爾哈赤從病重到死亡的大致過程是：
天命十一年七月二十三日，努爾哈赤因病前往現在的遼寧省清河縣洗浴（消毒）；
天命十一年八月初一日，病情惡化；
命令二貝勒阿敏殺牛燒紙祈福消災無任何效果；
天命十一年八月初七日，努爾哈赤的病情再次惡化，明知不久於人世，努爾哈赤決定返回瀋陽；
半路上遇到了大妃奉命趕來迎接；
天命十一年八月十一日，抵達瑗雞堡，距瀋陽40裡，下午的1:00~3:00左右，努爾哈赤在船上病逝。
袁督：
努爾哈赤因為寧遠之敗，氣火攻心背發毒瘡，死於八月初十。（只相差一天）
毛帥：
臣手下的耿仲明正在瀋陽刺探消息，於八月初二發回消息----努爾哈赤背生惡瘡。
八月初四，毛帥指派軍官士兵共150人滲透敵境詳細打聽----努爾哈赤背上確實患有毒瘡，在兵士的保護下到溫泉清洗。
八月十一日，努爾哈赤即歸瀋陽，船行到遼陽西古城堡河邊後，於午時死亡。
做為當時經歷過這件事的人以及相應的史料我們可以判定，努爾哈赤死於背疽，擴散快、毒性大，在當時那種醫療衛生條件下，最終不治身亡。
病情發展極快，因為就在不久前，努爾哈赤還在南征北戰，聯絡科爾沁諸部的結盟運動，我們不能排除所謂戰敗心理抑鬱遂發背疽的可能，但努爾哈赤卻絕不是被火炮所傷最終致死，這麼多當事人的敘述都不相信而偏聽道聽途說的流言，也沒有這種道理。
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