國家生物中心:與美國同步共享5株新冠病毒基因組序列

國家生物信息中心(CNCB)/國家基因組科學數據中心(NGDC)首批自主收錄的5株2019新型冠狀病毒基因組序列實現與美國NCBI核酸數據庫GenBank數據同步與共享。

國家生物信息中心(CNCB)/國家基因組科學數據中心(NGDC)首批自主收錄的5株2019新型冠狀病毒基因組序列實現與美國NCBI核酸數據庫GenBank數據同步與共享。

CNCB/NGDC建立的2019新型冠狀病毒信息庫(2019nCoVR)已匯交併整合全球範圍內產出的82株病毒的87條非冗餘基因組序列信息,是目前收錄2019新型冠狀病毒基因組數目最多的數據庫。

為了進一步擴大2019-nCoV基因組序列應用範圍,CNCB/NGDC與國際生物信息數據庫建立了數據同步共享機制,第一批自主收錄的5個2019-nCoV全基因組序列(序列編號為GWHABKF00000000-GWHABKJ00000000)已經在NCBI發佈。通過共享機制,國內研究人員只需將數據遞交一次,即可實現數據在CNBC/NGDC和NCBI同時發佈。

據悉,從2020年1月以來,陸續有30餘株2019新型冠狀病毒的基因組序列被國內外科學家破譯,絕大部分數據都遞交到由德國建立的全球流感序列數據庫(GISAID)系統。而2020年1月22日,我國搭建的新型冠狀病毒信息庫正式上線。國家生物信息中心/國家基因組科學數據中心一直致力於構建國家級組學數據存儲與共享公共平臺,力爭第一時間為國內乃至全球科學家提供基因組數據的存管用服務。此次疫情爆發後,新型冠狀病毒信息庫上線,保持該病毒基因組數據發佈動態,持續為國內外科研人員提供方便快捷的數據檢索及下載資源。

國家生物中心:與美國同步共享5株新冠病毒基因組序列


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