“９·１１”事件爆發後，美國政府立刻實施了多項緊急計劃，“末日計劃”也首次全面啟動運作。
為全面核戰爭準備的計劃
“末日計劃”，也稱為“續政計劃”（ＣｏＧ），是隻有在全面核戰爭爆發的情況下才會啟動的計劃，為美國官方最深藏不露的軍事機密之一。它的內容包括秘密逃難計劃、巧妙偽裝的地下碉堡、太空時代的通信系統。望文生義，所謂“續政”，也就是“延續政府”的簡稱。該計劃的本意是：一旦核大戰爆發，末日決戰真的到來，希望可以憑藉這些東西保護美國的政要，以協助美國政府重整建制，為受困的民眾提供基本服務，併發起有效的軍事報復行動，反制攻擊者。
“末日計劃”是冷戰時期美蘇核競賽的產物。這套計劃遠在１９５１年已開始執行。１９４９年８月，前蘇聯成功地完成了原子彈試爆，華盛頓的國防規劃人員就開始針對核彈攻擊的威脅，想出種種應對措施。１９５１年，杜魯門總統設立民防管理局，該局制訂了第一套首府疏散計劃。一年後，陸軍工程兵在距華盛頓不遠的弗吉尼亞州鄉間，稱作氣象山（也譯作韋瑟山）的地方開鑿山洞，準備建立一個龐大的地下碉堡。整個工程結束前，投下的經費已經超過１０億美元，使氣象山成為全美最大及最佳放射塵埃防護所。
“末日計劃”的技術層次在１９５０年至６０年代間曾停滯不前。１９８２年，美政府設立一個新的秘密單位，稱為國防動員規劃系統局，該局官員奉命向當時的副總統——老布什負責。在老布什接替里根主政之前，政府又花了３０多億美元改進指揮、控制及通信網絡，使“末日計劃”日臻完美。不過現在該計劃已不再強調以防輻射和核彈衝擊波為重點，轉而注重於高科技的通信設備，指揮、控制、通信成為新的三位一體。在整個“末日計劃”體系中，電腦、衛星、先進雷達的地位已不亞於核彈、核轟炸機及核潛艇。
保護總統接班人的“樹梢計劃”
“樹梢計劃”是“末日計劃”的一個重要組成部分。一旦美國遭受全國性威脅，每一位指定總統接班人，都會得到一個攜有作戰計劃、軍用密碼及其他基本資料的特別小組的支援。每一個特別小組將陪同各指定接班人，進駐散佈於全國各地的秘密指揮所；當美國總統失去行動能力時被指定依順序擔任最高統帥的官員每天都被嚴密追蹤，白宮通信局、聯邦急難管理局與五角大樓合作，用電腦跟蹤和記錄這些官員的行跡，隨時掌握他們住於何處。
美憲法規定，副總統是總統的第一接班人，所以在“９·１１”事件後，為防範本·拉登組織的神秘攻擊，確保能“續政”，副總統切尼便依法一直躲在山洞，而總統小布什則在外指揮全局。“在９·１１”事件當天，所有指定的美國總統接班人，包括眾議院議長丹尼斯·哈斯特爾特、參議院臨時主席羅伯特·伯德和全體內閣成員也都乘專用直升機飛到了位於弗吉尼亞氣象山地下名為海波因特特殊設施的掩體中，距華盛頓４８公里。海波因特佔地面積約為１８萬平方米，能容納數千人，包括一家醫院、數個餐飲娛樂和起居區、一座應急電站、一個廣播電視演播室、一條與白宮的直達通信線路、蓄水量為５０萬加侖的儲水罐和一處火葬場。過去海波因特專門設施只啟動過一次。
總統的“護膝”
“末日計劃”也為總統設計了一套周全的應急方案。危機時，如美白宮真地被襲，總統本人將由白宮的高科技空中指揮所“皇冠”號直升機送離辦公室，轉乘２４小時執勤的國家緊急空中指揮所（也稱“護膝”）專機，或在機上實施空中指揮，或飛抵安全的掩體進行地面指揮。這種專機是特別改裝過的波音７４７噴氣機，上面裝滿無線電通信設備，可以在空中停留長達７２小時。“護膝”專機共４架，不論何時，４架中總有一架在空中巡航；另一架則停在安德魯空軍基地。該基地距白宮不遠，約１０分鐘的直升機航程。在“９·１１”事件發生後，美特工處曾考慮把小布什從“空軍一號”轉到國家緊急空中指揮所上。
有卡才能受保護
除總統及其他被指定為總統接班人的官員外，“末日計劃”也負責疏散持有“疏散”識別卡的美國文武官員。列於聯合緊急疏散計劃名單中、持有“疏散一號”識別卡的４６位重要官員，可以在白天或夜晚任何時刻得到疏散，他們將搭乘直升機，飛往美國內各地的地下碉堡及指揮所。
“疏散一號”卡持有人，大多是在參謀長聯席會議各長官手下工作的軍方人員。另外還有２４８名“疏散二號”卡持有人，包括救災專家、五角大樓高級官員等等，也將搭機飛往各地的地下碉堡及指揮所，不過疏散這些人的工作只在早上９點到下午５點之間進行。如果危機發生在下班後，“疏散二號”卡持有人則必須自行開車到指定地點。總共有１０００多位政府和軍方官員被認為地位重要，關係到政府的持續運作，而列為疏散對象。
地堡多得像阿富汗的山洞
“末日計劃”的設計者，為讓攻擊者永遠不能確定，哪一個地下碉堡才是“正確”目標，也以多亂敵。把美全國分成１０個區，各區的“抗核子”地下碉堡指揮所總數多達５０個。各地下碉堡之間有衛星、地下電纜、高頻電波等聯繫。每個地方都可以作為臨時白宮，協調重新整編過的政府發揮功能，總統或其接班人可以在核彈攻擊進行中或終止後，使用其中任何一個地下秘密指揮所。這樣一來，就好像現在美軍在眾多的阿富汗山洞中難以找到本·拉登一樣，要想一下消滅美國的這些政要也非易事。
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