日本陆地面积约37.79万平方公里。 地形以山地为主，山地成脊状分布于日本的中央，将日本的国土分割为太平洋一侧和日本海一侧，山地和丘陵占总面积的71%，大多数山为火山。国土森林覆盖率高达67%。日本的平原面积狭小，耕地十分有限，人口生理密度高达2924人/平方公里，为世界第26位。
日本不仅国土面积很小，耕地面积更小！如此恶劣的“先天条件”下，日本人用12%的耕地面积，创下了世界第一的单位土地产量，种出了自给率达到50%的优质粮食，着实不易。
那么，日本农业因何而兴？更大的程度取决于生产模式以及农民素质。
生产模式先进、管理细致，是日本农产品质量佳的重要原因。在日本，无论种植何种作物，都能体现出日本农民“绣花”般的细心与精致。在一些地区，实行了无土栽培，温室大棚内种植的草莓、番茄等，其培育管理比苗圃、花圃还要精细，就像花卉盆景展示园一样。
在日本市场上的农产品，大都是色泽亮丽、规格统一、经过精心整理包装的。而且，农产品的包装箱上都印有产品名称、产地、生产者姓名。外在美的背后，是日本农民对农产品品质的刻意追求。例如，在梨园，每根梨树的枝条都被绑在钢丝网上，引导其平行向四周伸延，以最大限度地利用阳光和空间。由于坚持科学栽培，保证了梨的品质：个大、肉嫩、味美，每只梨都在0.25千克以上。
品种优是质量优的先决条件。日本政府除对大米的生产和流通实行一定的干预外，对其余农产品一律放开，由农民根据农协提供的市场信息和良种自行选择栽培。日本农民从事生产的一个重要目标是追求质量，所以日本农产品不但销路畅，而且价格优。
日本农户没有“小而全”，只有“大而专”。不为自给自足，而是专业化分工、工厂式生产。除了自己生产的几个品种外，其余生活所需的食品和农产品全都从市场上购买。这样既扩大了种养规模，获得了规模效益，又促进了农户与农户、农协与农协之间的合作与交流，繁荣了市场。
日本农户的生产规模都较大，一般农户全家只有2-3个劳动力，拥有土地50-70亩，个别农户达到200多亩，一个农户就是一个小型农业企业。日本农业机械化水平较高，每个农户都拥有所需的农机具，如收割机、喷药施肥机，以及土地起垅机、产品清洗包装机等。而且档次都比较高，使用起来很方便。同时，日本农家一般还设有一个专门用于清洗、整理、加工农产品的车间。
家庭经营与农协的社会化服务相结合。经过几十年的发展和完善，日本农协已发展成为集经济职能和社会职能于一体的民间团体，不仅负责组织农业生产，购买生产、生活资料，出售农产品等经济活动，而且还负责将政府的各种补助金分发给农户或有关团体，同时代表农民向政府行政部门反映意见，以保护农民的利益。
对资源保护高度重视。在日本，耕地保护不仅体现在“量”的维持上，更重要的是体现在“质”的保护上。在日本农村，所有刚翻耕过的耕作层均呈深褐色，土壤团粒结构良好，土质细而均匀，像海绵一样。
日本农民除了使用有机肥，也使用化肥，不过，使用的是专用复合肥。作物品种不同，复合肥的配方也不同。日本土质优良还要归功于土地的配套设施，无论种花、种菜，绝大多数农田在田垄下都埋有水管，土地干旱时打开水龙头就可灌溉；而叶面灌溉和施药则通过大棚顶端的管道喷雾。先进的生产设施对土壤保护和土质优化起到了十分重要的作用。
日本农民的实践证明，就算资源受限，通过模式，技术及技能也能让实现高效农业。不过，日本农业也有着很大的隐患：人口老龄化。在土地私有制的环境下，量少而价高的耕地伴随着老龄化问题的愈发严重将面临无人耕作的窘境，这会是日本农业，甚至是整个国家面临的最大问题！
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