助力精準醫療:生物銀行(UK Biobank)資料庫科研論壇在英國舉辦

助力精準醫療:生物銀行(UK Biobank)數據庫科研論壇在英國舉辦

導語

6月21日,英國生物銀行(UK Biobank)數據庫"2018年度科學大會"在倫敦成功舉辦。UK Biobank由牛津大學研究者在20多年前創辦,開闢了生物科技和數據科學相結合的嶄新領域,對世界衛生健康研究有著開創性的意義。我國科學家參與的中國慢性病前瞻性研究項目(China Kadoorie Biobank,CKB),被學界認為是UK Biobank的姊妹項目,二者是迄今為止少有的、數據信息全面的大規模研究項目。本文將介紹UK Biobank及其年度論壇的主要內容。

編譯 | 徐一 (利茲大學國際新聞系碩士研究生)

製版 | 王冠琳

英國生物銀行(UK Biobank)簡介

根據世界衛生組織報告,慢性非傳染性疾病如心血管疾病、腫瘤、糖尿病、慢性呼吸道疾病已佔全球人類死因的70% (1)。隨著全球人口老齡化,在未來幾十年,慢病發病率將顯著上升,併成為個人和全球健康與經濟最重的負擔。隨著大數據時代的到來,UK Biobank將生物科技和數據科學結合了起來,對世界衛生健康研究有著開創性的意義。

UK Biobank最早於1999年被提出,是由英國政府發起成立的一項預計歷時30年的研究計劃,是英國迄今以來規模最大的健康研究項目之一。其宗旨是為研究“遺傳和環境因素共同作用對患病風險影響”的科研人員提供其所採集的材料,建成世界上基因和環境因素信息最全的大規模人類信息資源庫,以探求基因、生活方式和健康之間的關係,促進對人類疾病病因的理解、提高人類生命質量。

UK Biobank已經在英國境內採集40至69歲人群中50萬份志願者(約英國總人口的0.8%)的基因信息和血液樣本、生活方式(包括飲食結構,睡眠和藥物使用等)及環境暴露數據,並跟蹤記錄他們之後數十年的健康醫療檔案信息。研究期間,所有疾病、藥品處方以及參加者死亡等都將被記錄在庫,以供英國國家醫療服務體系(NHS)利用並管理,成為了全球少數大規模的人體生物健康信息庫之一。

UK Biobank 2018年度科學大會

6月21日,UK Biobank“2018年度科學大會”在倫敦成功舉辦。數百名來自英國、美國、亞洲等世界各地生物醫學界研究者、企業家等共聚一堂,分享英國生物信息銀行發展最新成果,探討世界範圍內人類生命健康的挑戰機遇和前沿問題。

助力精準醫療:生物銀行(UK Biobank)數據庫科研論壇在英國舉辦

英國生物信息銀行首席執行官Rory Collins開幕致辭 (圖片來源:推特@uk_bioban

來自英國牛津大學、劍橋大學、美國哈佛大學等世界高校,UK Biobank,英國及歐洲健康生物醫學信息研究所的十餘名專家代表發佈主題演講,圍繞生物信息與醫療大數據、醫療影像、可穿戴設備、人工智能之間的結合與成果,及I型糖尿病,心腦血管疾病,眼部疾病、肥胖等生命健康威脅開展討論,並介紹了英國生物信息銀行如何利用現有信息數據資源推動健康科學研究和產業的發展。

基於系統生物學、生物信息學、醫學影像學、多組學檢測技術、大數據分析等領域的UK Biobank促進了精準醫學的迅速發展。例如

牛津大學的Aiden Doherty教授:結合人工智能科技和智能腕錶及可穿戴攝像頭採集的信息,可準確描述人體24小時裡不同活動類型(睡眠,騎車,走路,開車,划船等)和時間(4);

英國倫敦大學學院Steffen Petersen教授:開發出了人工智能技術,可進行心臟核磁共振影像的圖譜識別和動態重構,大大節省放射科醫師的時間成本,提高診斷精度(5);

哈佛大學醫學院Sekar Kathiresan教授:基於UK Biobank的遺傳數據,建立了可利用基因信息進行心肌梗塞患病風險的預測模型 (6);

……

會議上,牛津大學的UK Biobank流行病學專家Naomi Allen教授對UK Biobank5年來的成果進行了總結:

UK Biobank的50萬人數據庫於2012年3月正式開放以來,其數據資源持續為生物醫學發展貢獻力量。2016-2017年,UK Biobank先後展開生物標記物分析、醫學影像研究及大規模基因測序計劃,為藥物研發及疾病預測提供數據資源。目前已完成25000人的包括大腦、心臟、內臟、骨骼等在內的全身影像掃描。其生物樣本庫(50萬人的血液、DNA、尿液、糞便等)全部由智能機器人完成從低溫或超低溫庫裡獲取或儲存樣本,實現了50萬人的生物樣本庫保管全自動化、機器人智能化和精準化流程。

歡迎中國學者參與國際合作

UK Biobank為促進全球科學家跨學科,跨領域的合作提供了非常獨特的平臺。

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UKB註冊學者全球分佈 (來源:UK Biobank, Naomi Allen)

截止到2018上半年,來自美國、加拿大、巴西、澳大利亞、英國、中國、尼日利亞等世界各國在UK Biobank網站進行註冊的學者增長至7500名,國際學者漲幅逐年升高,有超過400個研究成果發表在不同學術領域的頂級國際期刊上,引用量逾3700次,主題涵蓋健康領域的遺傳學、心理疾病、心血管疾病、傳染病及癌症等疾病,社會科學,工程學以及健康經濟學等等。

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UKB世界範圍的科研合作(來源:UK Biobank, Naomi Allen)

UK Biobank最早由維康信託基金會,醫學研究理事會,英國衛生部,蘇格蘭政府和西北地區發展機構共同發起成立,也有來自威爾士政府,英國心臟基金會,英國癌症研究和英國糖尿病研究基金會等機構組織的資助,並得到英國國家醫療服務體系(NHS)的支持。

作為非營利性慈善機構,在保護志願者隱私的前提下,UK Biobank的信息數據對世界範圍內的研究人員開放,在經過倫理委員會(ethics committee)和理事會批准通過後,支付少許的管理費用便可獲得所申請數據。UK Biobank的科學傳播負責人Andrew Trehearne對《健康學人》表示,“我們很高興看到有一些來自中國的項目申請書,也歡迎更多的中國學者、企業加入進來,共同利用英國生物信息銀行的信息,攜手探尋生命真知,最終提高人類健康水平。”

參考文獻:

1. World Health Organization. Noncommunicable diseases progress monitor 2015. 2017. [cited 2018. 5.27].

2. Ollier. W, Sprosen, T and Peakman, T (2005). 'UKBiobank: from concept to reality' Pharmacogenomics6 (6) 639-646. Available from: http://www.who.int/nmh/publications/ncd-progress-monitor-2015/en/

3. 中國慢性病前瞻性研究項目簡介. 2004. [cited 2018. 6. 21]. Avaliable from: http://www.ckbiobank.org/site/

4. Matthew Willetts et al. Statistical machine learning of sleep and physical activity phenotypes from sensor data in 96,220 UK Biobank participants. Scientific Reportsvolume 8, Article number: 7961 (2018)

5. Suinesiaputra A et al. Fully-automated left ventricular mass and volume MRI analysis in the UK Biobank population cohort: evaluation of initial results, Int J Cardiovasc Imaging. 2018 Feb;34(2):281-291.

6. Amit V Khera et al. Genome-wide polygenic score to identify a monogenic risk-equivalent for coronary disease. bioRxiv 218388; doi: https://doi.org/10.1101/218388

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