7、8月是棉花生長髮育最旺盛的花鈴期，也是決定棉花產量和品質的最關鍵階段。雨澇造成棉花減產減收的主要原因，是棉田溼度過大，土壤通氣不良，棉花根系活力受阻，植株生長髮育遲緩，易發生紅葉莖枯病和爛鈴，品質降低。受澇棉花整株淹沒3天以上或浸泡7天以上的，根系腐爛變黃，頂葉枯死，此類棉苗存活可能性極小，需改種。棉花受災後根系受損，主根及側根變黃，根尖呈水漬狀，應採取“搶排水、早鬆土、重施肥、防病蟲、遲打頂、勤整枝”的應變措施。
1、清溝排水。澇災發生後立即清理田間溝系，搶時間排澇，加深畦溝和相應排水溝，儘快降低地下水位，降漬，保證棉花正常生長。
2、及時扶理棉株。受澇後棉花根系受損，棉株容易倒伏，應及時扶理，改善田間環境，同時要抓緊洗苗，把葉片、莖稈上的糊泥洗淨，以恢復葉片正常的光合作用，減少蕾鈴脫落。
3、及時鬆土壅根。田間積水排除後一週內，應及時鬆土壅根，破除土壤表面板結層，增加土壤通透性，改善根系環境，促進根系恢復，同時要培小高壟，提高棉株抗倒伏能力。之後，要及時中耕鬆土，促進根系生長。
4、科學追肥。長期淹水棉田氮肥、鉀肥、微肥的流失非常嚴重，花桃肥一定要重施。棉株受損較輕的，要及早重施花鈴肥；受損較重的，先看苗施用恢復肥，一般每畝施尿素10公斤，然後適當推遲施用花鈴肥，巧施蓋頂肥，做到開塘深施，快促猛攻，儘快使棉花轉入增節增蕾開花結鈴的高峰時期。淹水使棉花根系嚴重受損，養分吸收受阻，通過根外追肥，可以迅速補充棉花養分，增強棉花的抗漬耐澇性，減少棉花蕾鈴脫落。葉面噴肥時注意要在陰天或晴天的早、晚進行，濃度一定不能過大。
5、合理調整化控。棉花受澇後，生長髮育受阻，應根據苗情，適當減少化控用藥量或推遲化控時間。
6、適當推遲打頂。受淹棉花大部分蕾鈴脫落嚴重，生長高峰相對推遲。一般情況下，受澇棉株要比正常棉株的生育期推遲7天左右，大都沒有伏前桃，伏桃大幅減少。恢復生長後，極易萌發大量枝杈，消耗水肥，應及時整枝打杈。為彌補前期結鈴的不足，可通過推遲晚打頂3-5天，打頂時間以8月10日為最後期限，這樣可使單株果枝增加2-3個，單株成鈴增加3-5個。後期遇旱及時澆水，葉面噴施蓋頂肥，促進多結早秋桃。
7、病蟲防治。棉花受災後生長髮育受阻，蕾鈴脫落加重，棉株恢復生長後，枝葉幼嫩，抗病蟲能力差，前期蚜蟲、紅蜘蛛較多，後期易受棉鈴蟲等危害。雨澇後棉花枯萎病、黃萎病、盲椿象等病蟲害發生加重，應及時採取措施防範。發現爛鈴要及時擇拾，既可減少損失，又能有效控制病害傳播。
8、注重後期管理。棉花發生澇漬災害後生長髮育推遲，後期管理更應加強，以充分利用棉花的自我調節能力，減少產量損失。在恢復生長期間，必須加強整枝工作，減少新生葉枝和贅芽，減少養分無效消耗，保證後期結鈴有充足的營養基礎。水淹棉田因生育期推遲，易貪青晚熟。對貪青晚熟棉田，要在枯霜前20天，選擇晴暖天氣，每畝用40%乙烯利100-150毫升，加清水30-40公斤稀釋後噴施棉株一次，有良好效果。
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