太祖和高祖都屬於廟號，廟號起源於商朝，但周朝只有諡號而沒有廟號，廟號的正式使用是在漢朝，且漢朝也是廟號最嚴謹的朝代。
廟號原本只有太祖，沒有高祖。天子七廟：一祖二宗四親廟。一祖是始祖，使受封。二宗是太祖和太宗，太祖是始受命，即第一個接受天命的人。
帝起細微，撥亂世反之正，平定天下，為漢太祖，功最高，上尊號曰高皇帝。
這便是漢太祖高皇帝的由來，劉邦實際上是第一個正式有廟號的皇帝――太祖。
廟號最初是沒有高祖的，但廟號剛開始使用的時候，多數人搞不清楚廟號和諡號，包括司馬遷，《史記》便把諡號和廟號混用，稱劉邦為漢高祖，所以“高祖”相當於是司馬遷創造的。
既然有高祖這個廟號了，漢朝之後的朝代便開始用了，魏晉南北朝時期廟號已經被用亂了。曹操是魏太祖，曹丕是魏高祖。
劉裕是宋高祖，劉義隆是宋太祖。所以，太祖和高祖區別不大，經常混用。
至宋朝趙匡胤後，廟號重新規範化，取消了高祖，開國之主就是太祖。
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