三維模型既是面向功能的，又是面向數據流的。從功能方面看，它指出了集成化的信息系統具有跨部門、跨功能，使各層次有所貫通，使各種功能能夠相互結合的集約化管理特徵，即“功能集成”。然而，這些功能模塊必須是在集成化的數據環境中運行的，分散、混亂、無序的數據環境不能支持集約化管理的跨部門、跨功能、各層次貫通、各種功能的相互結合。
功能模塊都是按數據中心原理去存取集成化的數據存儲，即功能集成是以“數據集成”為基礎的。對於有一定應用基礎和一些分散的MIS的企業來說，信息系統的集成並不是搞些接口連接的問題，而是建立企業信息基礎設施，進行規範化的信息資源管理和重新規劃設計企業集成信息系統的再造工程。與之同步甚至為其先導的，則是業務過程的重新設計(Business Process Reengineering，BPR)。應該看到，BPR是指對經營方式、部門界限和管理機制進行根本性的結構改革，要經過嚴格評估，拋棄過時的處理方式，利用最新技術建立新的業務過程。
BPR項目面臨的最大障礙有:企業管理部門缺乏實質性的投入和領導;對BPR概念的錯誤理解，使企業主要領導對BPR項目提出不現實的規模和期望;變革阻力在企業裡到處都有，大部分來自中層管理部門。由此可見，要搞全企業MIS的集成與業務過程重建，是有相當大的困難和風險的，只有經過管理上和技術上的充分準備，特別包括在理論借鑑方面的準備，在條件成熟時才能進行。
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