自从彻悟之后，从此开始认真用功，依照功过格每日反省，明显感觉到自己与以前不同了，以前我是整日里浑浑噩噩过着悠闲放任的生活，现在则是每日都战战兢兢，心存危俱，时刻都有警惕的念头，尤其是在一个人独处的时候，更是心存敬畏不敢造次，生怕一时生起恶念，得罪天地鬼神。以前如果有人讨厌我、说我坏话、对我有意见或对我不敬，我是万万不能接受、睚眦必报的，现在则是心量渐开，遇到别人毁谤，我也丝毫不挂碍于心，而是能安然包容接受，一笑而过。
我是三十五岁遇到的云谷禅师，每二年（1570）我便参加礼部的科举考试，原本孔先生算定我该考第三名，可是我竟然高中头名。孔先生为我所推算的命运第一次没有灵验，可见命数真的是可以改变的。孔先生算我命里没有功名只能考中秀才（相当于现在的高中），现在我却能得偿所愿在秋闱中考中举人。（相当于现在的大专、本科）
然而我虽然把过失改了许多，也做了不少好事，但是却做的远远不够纯粹，还掺杂着自己的好多私心杂念，反省自己的行为，在行善过程中还存在有很多过失：比如有时看见要做的善事，行动时却不够果断勇猛；有时帮助别人时，心中却常常迟疑；有时虽然勉强做了善事，可说话却不招人待见，往往显的失礼、刻意，不是那么自然。我之前说过，我还喜欢喝酒，在没喝之前清醒的时候还行，我能注意自己的言行，把持自己，但是一旦喝多了，就会放飞自我，不管不顾，把善念抛之脑后。唉！这么多年，虽然我常做善事积了一些功德，但是所犯的过失也很多，功过相抵，也只能算是虚度了如许光阴。
我自从隆庆三年已巳年（1569）听从云谷禅师教诲，发愿求取功名至万历七年已卯年（1579）经历了十一年，三千件善事才圆满完成。由于我常年在外，曾经一度在李渐庵军中工作担任参谋，所以一直没有机会和时间进行回向。直到第二年庚辰年我从北方回来才有机会请性空法师、慧空法师等得道高僧在东塔禅堂完成回向，圆了我的心愿，自此我许下的三千善事的愿终于圆满了。
孔先生算我命中无子，现在我又想求子，所以我又发愿再行三千善事。由于我发愿诚心，所以感应天地，所发三千愿事还没有圆满，在第二年辛巳年，就生了一个男孩儿，取名叫：天启。
我每天行善，做一件善便记录在案，你的母亲，也跟着我一同行善，可谓夫唱妇随相得益彰，你母亲没有念过书不识字，就用鹅毛剪断成管，每行一善事便沾上印泥在家里的日历上印上一个红圈，有时是施舍食物给贫苦之人，有时是买来活物放生。有时一天能印上十多个红圈，也就代表做了十多件善事。我们从庚辰年发愿再行三千善事到癸未年，只用了四年的时间，便将三千善行都做得圆满了。所以再次请来性空法师等高僧在家中的佛堂做回向。同年的九月十三日，我又许下善行一万件的大愿，希望我能求得中进士。（相当于现在的博士、博士后、硕士）从癸未年到丙戊年，仅仅三年多时间，我又高中进士。朝廷派我去京都附近的宝坻县担任知县，我原本命中算定是要到偏远的四川当一个县长的，现在都发生了改变。
我在宝坻做县长的时候，也不忘行善，我准备了一本册子，我叫它“治心篇”，其实就是时刻反省自己内心善恶的记录本，每天早晨起来升堂，家人便将这本册子交给衙役，然后放在我的桌案上，我每天所行的善事和所犯的罪恶，一丝一毫都要记录在案。我每天晚上还要效仿宋代的“铁面御史”赵阅道，在自家庭院中设立香案，焚香祷告将一天所做的事情向天帝、鬼神禀报，不敢有丝毫隐瞒。
