我們從哪裡來？我們要往哪裡去？這兩個問題不僅對我們是一種困擾，對宗教和科學更是一種鬥爭。宗教宣稱人類是由上帝創造，在伊甸園裡亞當和夏娃創造了人類；對於科學來說，達爾文僅證明了進化論，並未證明我們從哪裡來。本書中埃德蒙·基爾希在古根海姆博物館將為我們揭曉“我們從哪裡來？”，誰知基爾希被人暗殺，在發佈會上發生的一切是鬥爭？是陰謀？還是基爾希的表演？
基爾希提出的兩個問題轟動了全世界，這將是對宗教的抗爭，他將米勒-尤列的實驗進行了延續，在其基礎上加入了熵元素，實驗從最初的核苷酸慢慢演變成雙螺旋形狀化合物“DNA”。這一實驗對宗教來說是一個重型炸彈，徹底顛覆了《創世紀》中的人類起源一說。
米勒-尤列實驗
米勒-尤列實驗：米勒和尤列複製了早期海洋和大氣中存在的水、甲烷、氨和氫等化學物質，對這種化合物進行加熱來模擬沸騰的海洋。然後他們用電荷模擬閃電對化合物進行電擊。最後他們讓化合物自然冷卻，就像地球上的海洋冷卻下來一樣。他們的目的就是從沒有生命的原始海洋中激發生命的火花，創造“原生湯”。
我們要往哪裡去？埃德蒙被暗殺後，蘭登教授為了埃德蒙的發現公佈天下，經過了政府和宗教的追殺，但一直幫助他們的“人”溫斯頓是一臺大型計算機，人工智能。而埃德蒙的對“我們要往哪裡去？”這個問題的答案就是：人類在未來很短的時間內，將會被人工智能取代。在原有生物分類的六界（生命的六個界：動物界、植物界、原生生物界、真細菌界、原始細菌界、真菌界）基礎上，新增了第七界：技術界。
埃德蒙建造了E 波，成為了他一生最大的成就，從而也誕生了溫斯頓。溫斯頓是一臺人工智能機器，而在書中他就是一個具有人類感情的機器，已和人類無異。丹布朗借溫斯頓貫穿全書，蘭登教授成功逃離政府的追捕，成功將埃德蒙的發現公佈出來離不開溫斯頓的幫助。最後的謎底，殺手任務的派遣，王宮的電話號碼等均為溫斯頓佈局。埃德蒙給溫斯頓最後的命令：自我刪除。一臺人工智能機器能以人類的思維和感情去佈局，也側面證明了“我們要往哪裡去？”的答案，若人類真的被人工智能所替代，那麼人類的命運也將是雜交種了。
人類進化史
“人類正朝著某種不同的東西進化。”他說道，“我們正在成為一個雜交種--生物與技術融合的產物。今天活在我們體外的工具--智能手機、助聽器、閱讀眼鏡、大多數藥品，五十年後將被大量植入我們的體內。到那時我們就再也不是‘智人’了。”
《本源》是丹布朗2017年的鉅作，結合了當前的社會形式和傳統的宗教背景，在本書著作時他請教了很多宗教學者和科學教授。宗教和科學在以往都是相對立的，宗教的很多知識是科學無法解釋的，就像基督教內，人類的起源是上帝的創作，我們需要善意和諒解，當一個人打了你左臉一巴掌，你應該把右臉也給他打，並寬恕他。
丹布朗
在中國的宗教信仰是道教，由於道教的主張追求是長生不死、得道成仙、濟世救人、無為而治，以致於改革開放後道教慢慢的退出了我們的視野。但後來中國很多人信奉佛教和基督教，由於兩教主張的均是眾生平等，心懷善意，普渡眾生，現在國內慢慢的盛行起來了。作為無宗教信仰者的一句話：信奉宗教並無對錯，在社會上心懷善意，不危害社會危害他人即是善。
《本源》是集懸疑、高科技、偵探、言情一體的小說，在書的開頭以總懸念：我們從哪裡來？我們要往哪裡去？和各種小懸念共存，在書中通過各個小符號來給讀者設下謎題，“聖盃”“victor”“字母A”“達爾文魚”等，這些符號服務於故事的敘述。同樣在《天使與魔鬼》中，丹布朗也以各種符號來進行承接，給讀者設下懸念，牽引著讀者一步一步的解謎。在《本源》中，更有解密網來對劇情服務，每到一個關鍵點時，解密網發佈的信息領導著讀者進行下一步的探索。而在本書中解密網有一個無所不知的用戶[email protected]，將用戶名分解為“山上的教堂”而丘吉爾Churchill也可分解為山上的教堂，這個用戶就是溫斯頓，那臺人工智能機器。書中這樣的推理有很多，環環相扣，不斷給讀者帶來全新的視野。
